More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4135 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4135  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  666    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118225  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  88.39 
 
 
336 aa  581  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0277  hypothetical protein  77.02 
 
 
332 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  73.79 
 
 
332 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  45.97 
 
 
326 aa  268  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  45.03 
 
 
333 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.67 
 
 
327 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  43.71 
 
 
349 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.03 
 
 
331 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.92 
 
 
328 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  41.72 
 
 
339 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.62 
 
 
322 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  41.72 
 
 
334 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  44.03 
 
 
333 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.39 
 
 
349 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.81 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.28 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  41.61 
 
 
327 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.62 
 
 
339 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.81 
 
 
330 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.81 
 
 
330 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.26 
 
 
325 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.62 
 
 
323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.96 
 
 
358 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  42.05 
 
 
314 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  42.28 
 
 
353 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  43.23 
 
 
341 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  41.4 
 
 
371 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  40.07 
 
 
339 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.05 
 
 
326 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  41.95 
 
 
328 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  39.2 
 
 
324 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.47 
 
 
327 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  40.24 
 
 
330 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.82 
 
 
330 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  38.8 
 
 
337 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.27 
 
 
330 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.26 
 
 
324 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.38 
 
 
323 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  40.24 
 
 
330 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.42 
 
 
335 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.87 
 
 
325 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.93 
 
 
330 aa  229  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  38.99 
 
 
324 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.61 
 
 
356 aa  229  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.14 
 
 
328 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  40.94 
 
 
331 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.5 
 
 
332 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.67 
 
 
328 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  41.85 
 
 
324 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  39.73 
 
 
323 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.06 
 
 
328 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  41.38 
 
 
326 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  42.12 
 
 
325 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  42.02 
 
 
342 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.27 
 
 
338 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  38.8 
 
 
334 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  39.6 
 
 
327 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.28 
 
 
325 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 
328 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.28 
 
 
327 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.96 
 
 
330 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.34 
 
 
328 aa  225  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.94 
 
 
314 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.53 
 
 
331 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.47 
 
 
332 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.59 
 
 
339 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  37.33 
 
 
310 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  37.62 
 
 
344 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  39.93 
 
 
332 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  39.87 
 
 
333 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.18 
 
 
336 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  41.41 
 
 
325 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.02 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  40.67 
 
 
333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 
322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.91 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  39.05 
 
 
326 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  41.24 
 
 
337 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.06 
 
 
322 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.93 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  42.3 
 
 
359 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.58 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  40.58 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  38.59 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  39.53 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  40.53 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  39.07 
 
 
325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  39.34 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  38.26 
 
 
355 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  40.67 
 
 
335 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.92 
 
 
322 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  38.48 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  39.02 
 
 
334 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  37.92 
 
 
330 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  40.13 
 
 
330 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  36.34 
 
 
346 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  37.74 
 
 
322 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.46 
 
 
327 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  38.19 
 
 
327 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>