More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0277 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0277  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  664    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  77.41 
 
 		 336 aa  521  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  72.89 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4135  hypothetical protein  77.12 
 
 		 336 aa  481  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118225  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  42.46 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.48 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.04 
 
 		 327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  43.62 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.06 
 
 		 331 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.95 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.5 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  42.05 
 
 		 349 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.46 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.93 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.14 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.28 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.47 
 
 		 327 aa  242  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.83 
 
 		 336 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  40.38 
 
 		 327 aa  242  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  42.05 
 
 		 314 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.92 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  44.16 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.03 
 
 		 349 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.95 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  40.8 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.95 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.28 
 
 		 323 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  39.4 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  39.68 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  40.6 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  39.88 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.47 
 
 		 330 aa  235  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.47 
 
 		 330 aa  235  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  39.07 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.66 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.62 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.51 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.42 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  40.55 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.94 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  40.07 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.61 
 
 		 325 aa  233  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.33 
 
 		 328 aa  233  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  39.8 
 
 		 334 aa  232  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.4 
 
 		 320 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.61 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  39.51 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  39.31 
 
 		 324 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.73 
 
 		 331 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.73 
 
 		 331 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  40.92 
 
 		 327 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  39.09 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.93 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.25 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  40.6 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.82 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  39.06 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  40.27 
 
 		 333 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  40.43 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  37.95 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.93 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.59 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39.2 
 
 		 339 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  40.43 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  40.07 
 
 		 325 aa  228  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.26 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  37.95 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.88 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.41 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  39.74 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  40.54 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  39.31 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  42.37 
 
 		 337 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  40.65 
 
 		 324 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  39.09 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.13 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  39.87 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.7 
 
 		 325 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.93 
 
 		 314 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  39.27 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  43.23 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  39.81 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  39.81 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  39.2 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.75 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.2 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.28 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  38.28 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.66 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  38.24 
 
 		 335 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40 
 
 		 360 aa  225  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.43 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.82 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.21 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  41.8 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  41.06 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  38.93 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>