More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4707 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4707  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.836415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  76.54 
 
 		 328 aa  268  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  76.54 
 
 		 328 aa  268  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  72.78 
 
 		 327 aa  260  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  64.13 
 
 		 322 aa  256  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  64.45 
 
 		 328 aa  255  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  72.04 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  62.75 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  63.93 
 
 		 323 aa  242  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  63.69 
 
 		 308 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  49.28 
 
 		 327 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  50 
 
 		 337 aa  191  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  46.34 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  50.28 
 
 		 327 aa  188  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.65 
 
 		 330 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  49.44 
 
 		 330 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  47.75 
 
 		 327 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  46.67 
 
 		 336 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  46.54 
 
 		 332 aa  177  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  47.21 
 
 		 319 aa  177  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  45.54 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  48.62 
 
 		 326 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  47.57 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.19 
 
 		 326 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  51.98 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.06 
 
 		 333 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  42.56 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  48 
 
 		 322 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5149  extra-cytoplasmic solute receptor  41.9 
 
 		 328 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.79218  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  46.04 
 
 		 325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  50.54 
 
 		 324 aa  165  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.95 
 
 		 328 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  46.93 
 
 		 327 aa  164  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  50.57 
 
 		 349 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  41.78 
 
 		 344 aa  164  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.46 
 
 		 327 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.87 
 
 		 318 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  47.19 
 
 		 328 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  40.48 
 
 		 361 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  43.2 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  48.6 
 
 		 327 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  45.3 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0449  hypothetical protein  45.11 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203149  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.87 
 
 		 358 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  46.45 
 
 		 328 aa  161  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  45.81 
 
 		 326 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  46.29 
 
 		 332 aa  160  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  44.21 
 
 		 325 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  47.03 
 
 		 314 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  47.49 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  47.49 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.48 
 
 		 318 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  42.78 
 
 		 326 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  43.39 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  45.16 
 
 		 341 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  42.93 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  40.69 
 
 		 343 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  45.27 
 
 		 328 aa  158  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4242  extra-cytoplasmic solute receptor  39.9 
 
 		 330 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.289881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  44.94 
 
 		 325 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.09 
 
 		 328 aa  157  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1136  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.573559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  47.57 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.84 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  45.05 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.97 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  44.93 
 
 		 329 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  46.41 
 
 		 324 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  46.86 
 
 		 334 aa  155  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  46.07 
 
 		 338 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  41.97 
 
 		 325 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  38.92 
 
 		 327 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  39.89 
 
 		 327 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5359  extra-cytoplasmic solute receptor  38.92 
 
 		 323 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00868603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.33 
 
 		 331 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  42.65 
 
 		 325 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  41.06 
 
 		 331 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  46.2 
 
 		 339 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40.89 
 
 		 334 aa  154  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.96 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.8 
 
 		 328 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  43.33 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  42.11 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4223  extra-cytoplasmic solute receptor  43.46 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0796335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  41.26 
 
 		 326 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  45.51 
 
 		 331 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5869  extra-cytoplasmic solute receptor  45.3 
 
 		 346 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  41.38 
 
 		 328 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  44.17 
 
 		 337 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  43.01 
 
 		 325 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  43.01 
 
 		 325 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.25 
 
 		 345 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.25 
 
 		 345 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  45.81 
 
 		 320 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  41.4 
 
 		 335 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  46.29 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0711  hypothetical protein  40.89 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.926486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  44.94 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.03 
 
 		 323 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>