More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5327 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  52.04 
 
 		 326 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  49.21 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  49.21 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  49.21 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  46.67 
 
 		 326 aa  312  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  48.68 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  47.96 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  50.58 
 
 		 340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  40.13 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  35.74 
 
 		 325 aa  195  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  38.16 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  37.46 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  38.46 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  34.72 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  36.92 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  35.19 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  35.91 
 
 		 333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  35.29 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  39.01 
 
 		 332 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  36.27 
 
 		 326 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  35.78 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  32.2 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.06 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  35.64 
 
 		 323 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  35.86 
 
 		 323 aa  175  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  35.64 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  33.78 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  34.21 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  34.02 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  37.41 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  33.75 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  34.67 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  35.09 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  34.75 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  34.42 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  34.56 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  35.67 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  36.07 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  34.95 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  34.1 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  34.82 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  33.69 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  33.63 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  36.64 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  36.72 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  33.44 
 
 		 377 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  33.45 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  34.32 
 
 		 336 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  32.66 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  34.39 
 
 		 356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  34.01 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  30.98 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  35.58 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  35.09 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  35.08 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  35.11 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  32.89 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  34.38 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  38.26 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0906  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  32.89 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  32.77 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  36.56 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  32.79 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  29.24 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3493  hypothetical protein  34.12 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  34.88 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  36.01 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  31.37 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  34.74 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  32.18 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  38.2 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  32.67 
 
 		 325 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  31.78 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  34.38 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  35.22 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  36.47 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  33.13 
 
 		 352 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  31.27 
 
 		 321 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  34.27 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  30.03 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  35.53 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  31.12 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  31.96 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  37.45 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  32.57 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  32.43 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0620  hypothetical protein  34.59 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.41 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  33.83 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  32.43 
 
 		 328 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  37.79 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  34.67 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  32.82 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  34.91 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  32.88 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>