More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0183 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  44.11 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  38.59 
 
 		 319 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  36.98 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  37.36 
 
 		 322 aa  196  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  38.19 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  38.19 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  38.19 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  37.09 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  37.98 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  37.86 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.46 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  34.31 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  37.02 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  31.31 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.44 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  39.48 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  38.76 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.94 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.61 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.61 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  36.63 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  34.56 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  36.54 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  36.27 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  35.42 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38 
 
 		 358 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  38.97 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1077  hypothetical protein  33.22 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  31.33 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  32.97 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  32.14 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  37.59 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  36.64 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  35.14 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  36.05 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  36.9 
 
 		 346 aa  165  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  37.12 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.58 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  35.38 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  39.25 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  34.36 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.58 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  36.76 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  35.84 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  36.2 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.12 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  33.57 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  35.33 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  36.5 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  33.11 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0081  hypothetical protein  30.77 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  35.61 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  34.02 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.64 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  35.08 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  36.29 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  35.91 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  36.89 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  35.05 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  37.15 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  34.93 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  36.3 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  37.74 
 
 		 325 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  37.25 
 
 		 356 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  33.9 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  36.3 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  34.71 
 
 		 316 aa  159  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  37.59 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  32.57 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  35.37 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.18 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  37.88 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  36.81 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  37.7 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  35.31 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  40.31 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  37.76 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4341  extra-cytoplasmic solute receptor  36.07 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  36.49 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  34.38 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  32.69 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  32.07 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  32.49 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2897  hypothetical protein  36.33 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  36.33 
 
 		 331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.62 
 
 		 325 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  33.58 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  34.59 
 
 		 327 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  33.23 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  35.51 
 
 		 324 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  34.88 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  34.98 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  37.15 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  38.43 
 
 		 333 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  37.16 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  34.71 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  35.19 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>