More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2157 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  655    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  86.62 
 
 
320 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  63.92 
 
 
319 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  60.86 
 
 
327 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  36.88 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  31.33 
 
 
333 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  32.74 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  32.01 
 
 
327 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  32.5 
 
 
328 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  30.56 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  31.94 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  31.97 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  31.51 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  28.66 
 
 
324 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  28.66 
 
 
324 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  28.66 
 
 
324 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  31.69 
 
 
319 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  28.52 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  29.81 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  29.73 
 
 
327 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  29.81 
 
 
323 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  30.25 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  30.74 
 
 
327 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3032  hypothetical protein  31.7 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3386  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  31.7 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  31.88 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  32.12 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1077  hypothetical protein  28.93 
 
 
317 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  31.23 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  30.23 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  30.51 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  27.36 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  31.01 
 
 
331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  31.31 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  29.21 
 
 
350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  30.5 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  31.37 
 
 
333 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  31.33 
 
 
323 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.07 
 
 
326 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  27.04 
 
 
320 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  31.1 
 
 
332 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  28.37 
 
 
328 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  29.72 
 
 
327 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  27.56 
 
 
323 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  29.66 
 
 
329 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  27.03 
 
 
331 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  29.67 
 
 
332 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2286  hypothetical protein  28.23 
 
 
330 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  30.43 
 
 
355 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  30.89 
 
 
320 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  30.9 
 
 
331 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  29.09 
 
 
327 aa  122  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  35.39 
 
 
324 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  29.15 
 
 
315 aa  122  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  29.66 
 
 
329 aa  122  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  30.1 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1565  hypothetical protein  29.27 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  27.65 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  31.15 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  27.48 
 
 
377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  28.72 
 
 
337 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  28.34 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  28.38 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2124  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  30.88 
 
 
316 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  30.33 
 
 
339 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  30.16 
 
 
325 aa  119  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  28.9 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  29.55 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  29.51 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  27.85 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  28.85 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  29 
 
 
364 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0081  hypothetical protein  26.83 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  29.79 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  26.76 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  29.27 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  30.07 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  27.9 
 
 
348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  27.94 
 
 
328 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  34.84 
 
 
332 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  29.45 
 
 
333 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  28.19 
 
 
332 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2965  hypothetical protein  34.86 
 
 
353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  30.07 
 
 
330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  25.17 
 
 
333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1213  hypothetical protein  28.57 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421726  normal  0.0620299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  27.39 
 
 
333 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  27.39 
 
 
318 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  25.58 
 
 
383 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  27.33 
 
 
327 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0728  twin-arginine translocation pathway signal  28.76 
 
 
320 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  27.96 
 
 
325 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  29.76 
 
 
325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  29.76 
 
 
327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  28.92 
 
 
322 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  28.15 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  33.93 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  27.61 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  28.13 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  27.04 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>