More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1213 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1213  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421726  normal  0.0620299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  32.52 
 
 		 327 aa  143  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  33.68 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  31.53 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  32.1 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  30.31 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  30.11 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  31.53 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  29.1 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  31.56 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  30.14 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  29.52 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  31.16 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  28.09 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  26.96 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  32.64 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  29.87 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  30.83 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  30.8 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  29.87 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  31.54 
 
 		 325 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  33.46 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  31.54 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  29.89 
 
 		 356 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  31.5 
 
 		 331 aa  119  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  31.5 
 
 		 331 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  29.29 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  30.28 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  36.84 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3593  hypothetical protein  30.08 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  31.37 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  28.72 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  30.27 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  30.34 
 
 		 358 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  31.3 
 
 		 318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  30.07 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  26.81 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  30.07 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3566  hypothetical protein  31.03 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00357296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  29.5 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  26.92 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  28.63 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  29.9 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  28.66 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  27.55 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  28.96 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  31.16 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  30.91 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  28.22 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  28.35 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  30.04 
 
 		 335 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  33.06 
 
 		 420 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  31.33 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  28.01 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  29.64 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  29.12 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  29.55 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  31.5 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  28.41 
 
 		 327 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  28.52 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  29.02 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0962  hypothetical protein  29.21 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3493  hypothetical protein  28.42 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103315 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  29.02 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  28.06 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  29.77 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  28.27 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  29.55 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  29.81 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  29.12 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  27.8 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  27.25 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  26.65 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  26.62 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  27.99 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  27.84 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  32.46 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  28.84 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  31.48 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  29.55 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5776  hypothetical protein  32.33 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  31.23 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  30.43 
 
 		 326 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2932  hypothetical protein  29.72 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  26.62 
 
 		 362 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  28.24 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  30.26 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0990  twin-arginine translocation pathway signal  28.91 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  28.52 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  30.47 
 
 		 326 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  30.09 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  31.28 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  28.24 
 
 		 316 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3021  hypothetical protein  30.77 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1881  hypothetical protein  30.15 
 
 		 322 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  28.11 
 
 		 353 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0295  hypothetical protein  31.23 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  29.52 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  29.17 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>