More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1881 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1881  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5776  hypothetical protein  75.76 
 
 		 329 aa  472  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.91 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.91 
 
 		 325 aa  245  9e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.14 
 
 		 332 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.02 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.94 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.06 
 
 		 330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.86 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.8 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  40.25 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.58 
 
 		 335 aa  232  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.25 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  38.51 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.95 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.93 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  41.36 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.62 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  39 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  41.38 
 
 		 327 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.44 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.67 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.33 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  38.87 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.51 
 
 		 322 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  41.75 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.03 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.14 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  38.8 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.86 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  41.72 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.19 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.93 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.2 
 
 		 336 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  222  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  222  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.19 
 
 		 328 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  40.13 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.36 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.59 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  42.05 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40.53 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  38.87 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.8 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.8 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.67 
 
 		 339 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.86 
 
 		 322 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.75 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.69 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  38.31 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.65 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  39.13 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.46 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  41.14 
 
 		 386 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  38.23 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  41.69 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.69 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  35.51 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  40.5 
 
 		 330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  38.72 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.85 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  40.27 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.69 
 
 		 345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.13 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.85 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  37.66 
 
 		 327 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  35.44 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.63 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  40.59 
 
 		 322 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.96 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.82 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 		 335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  37.71 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.31 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  41.64 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  36.58 
 
 		 349 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.69 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  39.35 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  36.02 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.27 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  39.13 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.25 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  37.11 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  36.36 
 
 		 337 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  37.11 
 
 		 329 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  39.67 
 
 		 341 aa  212  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.53 
 
 		 339 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.29 
 
 		 327 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.71 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  38.64 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  39.2 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  37.16 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.25 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  37.5 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.73 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>