More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3493 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3493  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.87 
 
 
325 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.1 
 
 
325 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.61 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.61 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.92 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5386  hypothetical protein  41.08 
 
 
324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.45 
 
 
333 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3496  hypothetical protein  39.45 
 
 
327 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.192421 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.38 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.24 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.54 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  36.58 
 
 
324 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  33.74 
 
 
320 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.04 
 
 
327 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.04 
 
 
325 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  39.26 
 
 
323 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.29 
 
 
304 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  38.89 
 
 
332 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  38.11 
 
 
332 aa  208  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.26 
 
 
331 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.25 
 
 
327 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.07 
 
 
325 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.21 
 
 
330 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.49 
 
 
356 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  34.64 
 
 
336 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.42 
 
 
321 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5303  hypothetical protein  37.69 
 
 
325 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  35.58 
 
 
327 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37 
 
 
330 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.77 
 
 
318 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  36.34 
 
 
333 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  38.72 
 
 
326 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 
322 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  34.69 
 
 
331 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.64 
 
 
339 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.95 
 
 
330 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  41.22 
 
 
349 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  36.72 
 
 
345 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  36.72 
 
 
345 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.54 
 
 
328 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  35.74 
 
 
360 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  34.58 
 
 
325 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  38.05 
 
 
332 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.98 
 
 
328 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  35.74 
 
 
329 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  38.04 
 
 
334 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.28 
 
 
339 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.98 
 
 
329 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  36.16 
 
 
335 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  37.12 
 
 
328 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  35.14 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  35.12 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  34.77 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  35.37 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  35.51 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  34.77 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  38.67 
 
 
337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.21 
 
 
324 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  36.09 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  33.54 
 
 
323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  35.41 
 
 
329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  37.04 
 
 
330 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  36.39 
 
 
333 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  34.06 
 
 
326 aa  199  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  36.84 
 
 
330 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  36.06 
 
 
330 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  35.55 
 
 
328 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  34.67 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  39.48 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  35.45 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  37.22 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  34.67 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  36.88 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  34.13 
 
 
334 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  37.33 
 
 
329 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  35.33 
 
 
333 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.63 
 
 
331 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  35.91 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  34.67 
 
 
334 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  37.58 
 
 
325 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  34.38 
 
 
345 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36.33 
 
 
336 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  39.32 
 
 
339 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.88 
 
 
327 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  36.91 
 
 
330 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  36.91 
 
 
330 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  37.62 
 
 
326 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.59 
 
 
333 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.58 
 
 
325 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  33.85 
 
 
333 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  35.66 
 
 
325 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  36.89 
 
 
337 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  34.95 
 
 
326 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  34.24 
 
 
326 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  34.31 
 
 
325 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1347  hypothetical protein  36.1 
 
 
327 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44147  normal  0.036943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  34.35 
 
 
327 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  35.67 
 
 
336 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.65 
 
 
326 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>