More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0295 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0295  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4297  hypothetical protein  44 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3573  hypothetical protein  38.7 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  39.12 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  39.55 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  41.14 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  39.23 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  40.8 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.24 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.39 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  39.02 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  40.41 
 
 		 362 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  39.16 
 
 		 335 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.03 
 
 		 325 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  38.57 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.68 
 
 		 318 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.19 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.29 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  37.46 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  38.85 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.25 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  43.66 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.68 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  35.71 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  39.05 
 
 		 331 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  36.56 
 
 		 321 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.36 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.93 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.36 
 
 		 331 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.57 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.18 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  40.26 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  37.34 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  38.8 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  43.19 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.83 
 
 		 344 aa  195  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.38 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.38 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.46 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  38.18 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.24 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.42 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.21 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.79 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.97 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  38.1 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  40.74 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.66 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.46 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  39.62 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  36.51 
 
 		 325 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  36.42 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  36.91 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  38.51 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  36.42 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  35.33 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  35.58 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  35.83 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5403  hypothetical protein  36.33 
 
 		 340 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.848586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  38.18 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1994  hypothetical protein  38.28 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00362251  normal  0.711901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.84 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  38.19 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1794  hypothetical protein  38.28 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0184484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  36.88 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  38.87 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  38.26 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  36.04 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  36.82 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.25 
 
 		 327 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.31 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  37.95 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.14 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  38.57 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.93 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.39 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  36.25 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  35.46 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  38.67 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  38.31 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.61 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  38.85 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.54 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  34.41 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4073  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  36.42 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3417  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  185  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.12 
 
 		 337 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  34.89 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  38.44 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  35.69 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  35.86 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  34.1 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  38.36 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  35.74 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  39.24 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.74 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>