More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5403 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5403  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  679    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.848586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3573  hypothetical protein  55.14 
 
 		 336 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  39.06 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.93 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.88 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.88 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  34.64 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.94 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  37.88 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.27 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  41.58 
 
 		 322 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.46 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.18 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2124  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  36.05 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  36.81 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.67 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.76 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  34.87 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.54 
 
 		 335 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3532  hypothetical protein  36.45 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  34.38 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  35.51 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  33.86 
 
 		 322 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.26 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  37.54 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4297  hypothetical protein  34.45 
 
 		 321 aa  192  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  37.01 
 
 		 330 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  34.07 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0295  hypothetical protein  36.49 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  39.1 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  35.13 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.7 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  35.17 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.6 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.25 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  36.34 
 
 		 344 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  37.95 
 
 		 321 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.79 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  37.09 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  37.66 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  39.47 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0157  twin-arginine translocation pathway signal  37.21 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  37.69 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  36.79 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.42 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37.42 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.15 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40.36 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5766  hypothetical protein  38.94 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500598  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  35.54 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.02 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  36.84 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.98 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.21 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  34.78 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  33 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  36.42 
 
 		 326 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  37.85 
 
 		 330 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  37.75 
 
 		 323 aa  186  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  37.09 
 
 		 334 aa  185  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.54 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5655  hypothetical protein  34.76 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.315231  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.04 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  35.91 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.63 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.15 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.21 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.12 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.21 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  35.5 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1189  hypothetical protein  38.08 
 
 		 330 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  36.21 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  34.53 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  35.01 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6079  hypothetical protein  37.55 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  35.71 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  35.5 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  39.78 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  33.77 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.11 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  38.38 
 
 		 332 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.18 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  34.28 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  38.59 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  33.89 
 
 		 326 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  37.08 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  36.91 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  31.88 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.18 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  34.59 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3593  hypothetical protein  36.21 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  35.88 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  34.27 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  35 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.45 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  39.46 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  33.22 
 
 		 314 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  36.07 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>