More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3931 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  644    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  32.6 
 
 
324 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  32.6 
 
 
324 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  32.6 
 
 
324 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  35.87 
 
 
326 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  35.4 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  30.77 
 
 
323 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  33.69 
 
 
322 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  36.14 
 
 
333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  31.33 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  33.78 
 
 
327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  33.88 
 
 
326 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  31.51 
 
 
318 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  32.66 
 
 
327 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  33.23 
 
 
320 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5503  extra-cytoplasmic solute receptor  34.28 
 
 
322 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3055  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150263  normal  0.0186232 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  30.28 
 
 
316 aa  149  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  34.97 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  32.04 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  31.89 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1565  hypothetical protein  33.67 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  32.54 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  32.54 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  31.17 
 
 
327 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  32.3 
 
 
321 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  34.42 
 
 
329 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3410  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  32.65 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.523204  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  34.05 
 
 
325 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  33.33 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  35.2 
 
 
340 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  29.47 
 
 
331 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  36.16 
 
 
333 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  34.06 
 
 
329 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  31.46 
 
 
323 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  30.6 
 
 
331 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  33.11 
 
 
323 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3581  hypothetical protein  35.02 
 
 
331 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0733859  normal  0.0164081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  30.65 
 
 
321 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  31.23 
 
 
322 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  33.83 
 
 
333 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  31.23 
 
 
333 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  32.08 
 
 
325 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  32.57 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  33.82 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  30.72 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  31.21 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  34.92 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  30.5 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  34.15 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  33.45 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  32.55 
 
 
339 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  33.45 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  32.11 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  32.17 
 
 
327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3032  hypothetical protein  28.77 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  33.09 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  34.41 
 
 
332 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  33.11 
 
 
332 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3386  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  28.77 
 
 
318 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  29.69 
 
 
322 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3211  hypothetical protein  31.97 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119148  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  31.38 
 
 
320 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  31.37 
 
 
326 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  34.63 
 
 
322 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  32.09 
 
 
325 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  32.99 
 
 
325 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  35.42 
 
 
330 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  32.42 
 
 
302 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  30.69 
 
 
323 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  30.85 
 
 
339 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  30.79 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  32.46 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  32.96 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  32.96 
 
 
333 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  32.99 
 
 
420 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3823  hypothetical protein  31.53 
 
 
330 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363673  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2124  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  32.59 
 
 
316 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  35.07 
 
 
326 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  32.72 
 
 
335 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  33 
 
 
328 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  35.74 
 
 
344 aa  136  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  32.4 
 
 
335 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  35.74 
 
 
341 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  32.43 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  35.27 
 
 
341 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  31.29 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  30.34 
 
 
314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  30.89 
 
 
327 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  32.65 
 
 
322 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  33.82 
 
 
334 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  32.09 
 
 
332 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  33.83 
 
 
328 aa  135  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  33.83 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  32.34 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  34.2 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  31.46 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  27.88 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  31.4 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>