More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4068 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  80.55 
 
 
324 aa  501  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  76.59 
 
 
326 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  63.21 
 
 
327 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  60.97 
 
 
323 aa  408  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  60.97 
 
 
323 aa  407  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  62.75 
 
 
327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  47.74 
 
 
328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  46.98 
 
 
338 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  45.05 
 
 
377 aa  288  9e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  44.92 
 
 
331 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  44.18 
 
 
335 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  45.82 
 
 
331 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  43.61 
 
 
332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  42.86 
 
 
336 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  45.27 
 
 
333 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  45.02 
 
 
325 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  42.71 
 
 
324 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  41.28 
 
 
331 aa  255  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  38.9 
 
 
383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  40.48 
 
 
339 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  41.2 
 
 
327 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  42.18 
 
 
326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  37.67 
 
 
318 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  37.33 
 
 
332 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.26 
 
 
321 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.13 
 
 
349 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  38.82 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.41 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  35.29 
 
 
332 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.46 
 
 
326 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.63 
 
 
322 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.39 
 
 
330 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.8 
 
 
327 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.8 
 
 
325 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  36.15 
 
 
333 aa  178  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  36.6 
 
 
326 aa  178  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  36.31 
 
 
321 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  37.41 
 
 
334 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.73 
 
 
318 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38.46 
 
 
322 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5298  hypothetical protein  36.36 
 
 
314 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.98 
 
 
327 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.07 
 
 
330 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.07 
 
 
330 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  34.58 
 
 
327 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  39.02 
 
 
331 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.54 
 
 
358 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.07 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  34.42 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.82 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.33 
 
 
331 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  36.33 
 
 
322 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  35.05 
 
 
324 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  36.03 
 
 
320 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  35.37 
 
 
331 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  36.73 
 
 
351 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.19 
 
 
327 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.57 
 
 
304 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  36.04 
 
 
332 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  36.79 
 
 
331 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  37.07 
 
 
322 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  34.81 
 
 
323 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  34.43 
 
 
330 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  33.75 
 
 
326 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  33.79 
 
 
318 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  34.32 
 
 
330 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.06 
 
 
333 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  38.89 
 
 
327 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  32.06 
 
 
325 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3493  hypothetical protein  35.6 
 
 
323 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  33.01 
 
 
332 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36.81 
 
 
331 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  40.86 
 
 
329 aa  168  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.52 
 
 
324 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  34.48 
 
 
328 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  34.62 
 
 
314 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  35.64 
 
 
322 aa  168  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  38.16 
 
 
320 aa  168  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  34.67 
 
 
324 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  34.93 
 
 
328 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3609  hypothetical protein  36.82 
 
 
339 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal  0.0172311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  33.55 
 
 
342 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2312  hypothetical protein  37.37 
 
 
330 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258984 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  35.57 
 
 
330 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  33.88 
 
 
327 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  35.35 
 
 
326 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  35.71 
 
 
344 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  34.11 
 
 
352 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  35.56 
 
 
329 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  36.3 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  34.21 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  35.29 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  35.86 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.93 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.67 
 
 
333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1849  hypothetical protein  35.22 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.210601 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  40.86 
 
 
329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  39.41 
 
 
325 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  34.69 
 
 
364 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>