More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4137 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  661    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  82.77 
 
 
324 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  77.29 
 
 
315 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  61.47 
 
 
327 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  61.54 
 
 
327 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  57.28 
 
 
323 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  57.28 
 
 
323 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  49.06 
 
 
328 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  47.37 
 
 
377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  47.38 
 
 
331 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  45.77 
 
 
332 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  42.99 
 
 
336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  45.3 
 
 
338 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  42.99 
 
 
335 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  44.92 
 
 
327 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  45.77 
 
 
331 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  44.41 
 
 
333 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  46.05 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  41.12 
 
 
318 aa  262  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  43.03 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  41.43 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  40.3 
 
 
383 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  43.05 
 
 
324 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  40.54 
 
 
326 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.03 
 
 
326 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.46 
 
 
336 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.98 
 
 
322 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  38.41 
 
 
332 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  35.08 
 
 
342 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.15 
 
 
320 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  40.07 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  37.58 
 
 
332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  37.14 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.54 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  37.29 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.11 
 
 
323 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  37.7 
 
 
321 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.41 
 
 
327 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.76 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.79 
 
 
328 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  36.45 
 
 
338 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  36.54 
 
 
322 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  38.52 
 
 
338 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  35.29 
 
 
327 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  41.76 
 
 
353 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  38.81 
 
 
323 aa  176  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.98 
 
 
333 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  37.5 
 
 
322 aa  176  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.56 
 
 
326 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  41.38 
 
 
328 aa  175  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  35.14 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  37.46 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.16 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.09 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.09 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.1 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  36.2 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  38.19 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  36.28 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.31 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  37.54 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  36.2 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.34 
 
 
330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  35.48 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  38.49 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  34.81 
 
 
326 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  39.56 
 
 
335 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  34.17 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.58 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  36.42 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.35 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  35.92 
 
 
327 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  35.4 
 
 
321 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.29 
 
 
327 aa  172  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  35.44 
 
 
322 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.16 
 
 
326 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  39.22 
 
 
333 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  35.94 
 
 
348 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  33.55 
 
 
323 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  36.79 
 
 
328 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.29 
 
 
325 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.57 
 
 
328 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  33.85 
 
 
324 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  37.82 
 
 
318 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  37.5 
 
 
330 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3213  hypothetical protein  38.62 
 
 
327 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308307  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.94 
 
 
339 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  35.85 
 
 
322 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  37.98 
 
 
323 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  37.64 
 
 
339 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  37.37 
 
 
328 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  34.15 
 
 
327 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.25 
 
 
330 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.25 
 
 
330 aa  169  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  40.62 
 
 
329 aa  168  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  32.06 
 
 
319 aa  168  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1221  hypothetical protein  38.01 
 
 
315 aa  168  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  36.07 
 
 
322 aa  168  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3493  hypothetical protein  33.54 
 
 
323 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  35.26 
 
 
332 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>