More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4691 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  82.46 
 
 		 326 aa  551  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  80.34 
 
 		 315 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  62.79 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  62.46 
 
 		 327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  57.14 
 
 		 323 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  57.14 
 
 		 323 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  45.34 
 
 		 328 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  45.23 
 
 		 377 aa  298  9e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  48.12 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  46.08 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  45.3 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  43.61 
 
 		 336 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  44.83 
 
 		 331 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  45.36 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  45.61 
 
 		 333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  40.94 
 
 		 335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  41.54 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  43.4 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  42.91 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  43.3 
 
 		 339 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  39.82 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  38.89 
 
 		 318 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  40.74 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  37.18 
 
 		 342 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.86 
 
 		 358 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.67 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.31 
 
 		 322 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.79 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  35.39 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  36.07 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.27 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  38.44 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  37.46 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.33 
 
 		 327 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.91 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.84 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  38.14 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.97 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  36.3 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.49 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  37.54 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.45 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  39.46 
 
 		 321 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.36 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  35.65 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  37.82 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  33.64 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  37.41 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.51 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.85 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  36.21 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.02 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  37.03 
 
 		 326 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  35.33 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  36.09 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  33.95 
 
 		 336 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  40.93 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  36 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  35.78 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3581  hypothetical protein  39.01 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0733859  normal  0.0164081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  35.91 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  36.48 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  37.22 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1221  hypothetical protein  36.3 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  38.21 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  33.54 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  37.05 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  34.37 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  40.62 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.19 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.06 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  35.83 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.06 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  37.89 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  38.08 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  34.17 
 
 		 348 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  38.57 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  35.69 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  35.07 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  40.62 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  35.31 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  32.62 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.4 
 
 		 314 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  32.72 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  34.69 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.26 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  32.62 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  36.31 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  38.91 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38.21 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  35.91 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  35.25 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  35.14 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  38.7 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>