More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4416 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  666    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  62.67 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  60.86 
 
 		 319 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  60.14 
 
 		 319 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  36.47 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  34.29 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  34.31 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  30.82 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1565  hypothetical protein  33.65 
 
 		 324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  34.95 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  33.56 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  33.22 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  33.22 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1077  hypothetical protein  33.45 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055057  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  32.89 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3386  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  34.22 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  32.77 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3032  hypothetical protein  33.84 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  34.55 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  32.66 
 
 		 320 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  31.08 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  32.48 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  32.48 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  30.77 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  30.69 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  31.4 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  32.19 
 
 		 336 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  32.19 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  32.32 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  29.25 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  29.14 
 
 		 335 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1213  hypothetical protein  32.52 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421726  normal  0.0620299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  31.95 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  28.67 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  30.77 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  30.1 
 
 		 315 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  31.73 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  30.72 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  29.43 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  30.52 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  28.05 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  30.6 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  29.15 
 
 		 324 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  28.88 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  32.33 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  28.23 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  28.98 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  28.47 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  29.41 
 
 		 358 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  30.33 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  29.28 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  29.41 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  28.62 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2286  hypothetical protein  31.33 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  29.24 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  31.06 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  29.3 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  33.22 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  30.77 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  27.78 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  30.24 
 
 		 346 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  28.29 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  27.76 
 
 		 339 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  32.69 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  29.67 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  30.27 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  29.93 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  28.28 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  28.48 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  27.04 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  28.76 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  33.47 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  26.46 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  32.42 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  27.7 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  29.14 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  27.94 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0623  hypothetical protein  26.61 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  29.22 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  29.15 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  29.24 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  27.24 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  29.1 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3092  hypothetical protein  28.57 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.23333  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  28.97 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  30 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  27.44 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  28.53 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  34.3 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2124  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  29.47 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  28.28 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  30 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  26.97 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  28.52 
 
 		 330 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  28.43 
 
 		 355 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  27.91 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  31.42 
 
 		 324 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  32.25 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  28.49 
 
 		 327 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  28.57 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>