More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5795 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  43.34 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  39.37 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  36.11 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  34.56 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  35.47 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  33.76 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  33.76 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  33.76 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  33.21 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  31.97 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  33.8 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  34.66 
 
 		 330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  30.45 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  36.62 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  31.15 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  35.78 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0081  hypothetical protein  30.39 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  32.99 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.9 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  37.98 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  34.45 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  31.47 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  35.86 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  36.07 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  36.43 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  35.66 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1077  hypothetical protein  32.2 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  34.07 
 
 		 320 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  32.75 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  35.29 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1565  hypothetical protein  33.77 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  35.96 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  34.81 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  34.72 
 
 		 348 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  37.74 
 
 		 339 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.42 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  35.96 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  35.14 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  37.78 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  32.8 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  37 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1898  hypothetical protein  32.83 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  32.97 
 
 		 318 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  33.23 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  36.86 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  32.79 
 
 		 316 aa  149  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.15 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  35.59 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  34.68 
 
 		 327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  34.81 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  33.68 
 
 		 334 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  34.08 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  34.66 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  33.54 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.77 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  34.71 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  35.04 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  33.22 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  34.34 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  34.69 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  35.59 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  34.42 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  32.67 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  33.1 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  33.12 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.22 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  32.88 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  32.88 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  35.27 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  33.77 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  32.86 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.6 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  36.66 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  33.02 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  33.08 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2897  hypothetical protein  35.69 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  35.36 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  33.64 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  33.1 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  35.98 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  33.96 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  34.06 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  34.73 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.29 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  35.22 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  35.36 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  32.58 
 
 		 356 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  31.1 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  33.97 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  35.21 
 
 		 332 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  32.41 
 
 		 331 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  35.25 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  35.53 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  33.45 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  34.29 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3797  extra-cytoplasmic solute receptor  35.48 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  36.16 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  33.1 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  33.9 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>