More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1898 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1898  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.64 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.95 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.71 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.71 
 
 		 330 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.75 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.75 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.75 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.77 
 
 		 331 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.62 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.62 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1429  hypothetical protein  44.88 
 
 		 321 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  39.69 
 
 		 324 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.85 
 
 		 325 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.05 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.21 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.76 
 
 		 331 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.59 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.14 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.42 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.52 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  42.9 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.53 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.39 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.52 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.52 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.2 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.92 
 
 		 356 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.09 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.05 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  41.58 
 
 		 333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.23 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  42.27 
 
 		 335 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.88 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  41.81 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.6 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  40.76 
 
 		 327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  39.68 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.06 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.52 
 
 		 339 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.08 
 
 		 335 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.47 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.33 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.33 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40.33 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  45.29 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.61 
 
 		 335 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  44.33 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.69 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  43.73 
 
 		 330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  40.14 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.14 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.87 
 
 		 333 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  39.8 
 
 		 329 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.78 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  39.16 
 
 		 318 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  41.75 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  42.96 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.08 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.48 
 
 		 349 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  45.51 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.56 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.13 
 
 		 327 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.73 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.24 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3875  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.229403  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.27 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  39.88 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  41.41 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.8 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.8 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.84 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.27 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  38.54 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.33 
 
 		 334 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.59 
 
 		 358 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.78 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  40.98 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.14 
 
 		 314 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  40.14 
 
 		 325 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  40.47 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.27 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  37.65 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  44.87 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.23 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.36 
 
 		 332 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.69 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  39.39 
 
 		 474 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.76 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  39.58 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  37.1 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  35.95 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.6 
 
 		 330 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  38.89 
 
 		 339 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  38.14 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.89 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>