More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2376 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  65.67 
 
 		 320 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  60.62 
 
 		 319 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  60.2 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  33.67 
 
 		 322 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  33.22 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1077  hypothetical protein  32.76 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  30.9 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  29.97 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  30.86 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  28.99 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  31.1 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1565  hypothetical protein  30.79 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  29.05 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  35.07 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3386  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  30.6 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  31.62 
 
 		 331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  31.39 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  29.49 
 
 		 335 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  32.61 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3032  hypothetical protein  30.25 
 
 		 318 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  29.84 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  31.29 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  29.06 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  29.43 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  29.06 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  29.8 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  30.48 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  29.06 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  31.29 
 
 		 322 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  32.22 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  29.77 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  30.06 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  29.84 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  28.62 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0728  twin-arginine translocation pathway signal  30.69 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  29.67 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  30.52 
 
 		 326 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  29.97 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  28.47 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  29.03 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  29.87 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  28.12 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  33.45 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  29.45 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  30.57 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  29.24 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  29.97 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  31.05 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  31.05 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  29 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  32.81 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  30.55 
 
 		 326 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21240  hypothetical protein  29.35 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00058939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  29.64 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  29.69 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3047  hypothetical protein  31.49 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  31.02 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  30.38 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  29.57 
 
 		 350 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  28.62 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  30.28 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  28.47 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  31.32 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  27.8 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  31.32 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  28.43 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1408  hypothetical protein  30.87 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  31.85 
 
 		 347 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  29.14 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  28.96 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  29.24 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  28.32 
 
 		 322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  32.26 
 
 		 351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  29.43 
 
 		 326 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  30 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  30.48 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  30.11 
 
 		 364 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  32.08 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  27.96 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  27.48 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  28.3 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  27.81 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  30.57 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  31.5 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  28.8 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  31.46 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  30.94 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  28.99 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  29.92 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  29.39 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  30.39 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2136  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  28.84 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  29.77 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  32.58 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  28.81 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  31.14 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  32.2 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>