More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2897 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2897  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  64.55 
 
 
346 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.86 
 
 
328 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.25 
 
 
324 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.99 
 
 
358 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.54 
 
 
326 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  43.12 
 
 
323 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.23 
 
 
325 aa  242  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.23 
 
 
327 aa  242  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.25 
 
 
336 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.54 
 
 
324 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.47 
 
 
328 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.47 
 
 
328 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.39 
 
 
339 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.94 
 
 
328 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  41.59 
 
 
332 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  41.98 
 
 
324 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.88 
 
 
325 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.86 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.94 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.05 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.5 
 
 
331 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  42.91 
 
 
341 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.75 
 
 
330 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.18 
 
 
328 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  42 
 
 
341 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.74 
 
 
324 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.92 
 
 
328 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.15 
 
 
327 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.61 
 
 
330 aa  229  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  42.01 
 
 
341 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.1 
 
 
310 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.09 
 
 
328 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  38.34 
 
 
334 aa  228  9e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.92 
 
 
331 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.52 
 
 
339 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.63 
 
 
324 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.97 
 
 
330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.97 
 
 
330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  41.9 
 
 
325 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.88 
 
 
328 aa  225  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  41.14 
 
 
332 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  39.69 
 
 
325 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40 
 
 
304 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  42.02 
 
 
341 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  40.91 
 
 
335 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  39.54 
 
 
324 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  40.06 
 
 
330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.52 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.18 
 
 
333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  40.56 
 
 
344 aa  222  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.81 
 
 
327 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  41.3 
 
 
327 aa  222  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  41.14 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.96 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.32 
 
 
330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  40.84 
 
 
326 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  38.82 
 
 
352 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.36 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.69 
 
 
349 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.52 
 
 
335 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  36.76 
 
 
326 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40.43 
 
 
334 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.81 
 
 
334 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.59 
 
 
328 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  41.25 
 
 
325 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.84 
 
 
322 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  36.62 
 
 
325 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  38.51 
 
 
330 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 
348 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.6 
 
 
322 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  41.08 
 
 
325 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.54 
 
 
335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.37 
 
 
335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.33 
 
 
356 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.16 
 
 
336 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  40.75 
 
 
325 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  39.19 
 
 
323 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  37.62 
 
 
326 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  41.89 
 
 
332 aa  215  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  38.68 
 
 
326 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  38.89 
 
 
343 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.95 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  39.8 
 
 
324 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.71 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  39.67 
 
 
359 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  40.33 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.1 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.69 
 
 
326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  41.16 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  39.04 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  38.37 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.78 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.29 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  41.41 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  39.53 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.14 
 
 
335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  39.27 
 
 
322 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.95 
 
 
329 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>