More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1073 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  46.77 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  41.85 
 
 
316 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  41.61 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1077  hypothetical protein  40.74 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055057  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  36.31 
 
 
333 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  33.22 
 
 
333 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  32.2 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  30.69 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  29.67 
 
 
319 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  28.52 
 
 
327 aa  143  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  30.66 
 
 
321 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  32.39 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  32.62 
 
 
325 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  34.55 
 
 
331 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  28.72 
 
 
319 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  31.53 
 
 
320 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  28.66 
 
 
327 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  30.34 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  31.6 
 
 
320 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  30.45 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  29.79 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  32.89 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  31.94 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  34.06 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  30.33 
 
 
323 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  31.06 
 
 
326 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  32.73 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  31.67 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  30.1 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  32 
 
 
329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  31.08 
 
 
324 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 
324 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  32.97 
 
 
339 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  32.56 
 
 
321 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  31.08 
 
 
324 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  27.7 
 
 
315 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 
327 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  30.85 
 
 
331 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  28.91 
 
 
322 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  31.99 
 
 
317 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  33.44 
 
 
327 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  28.71 
 
 
331 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 
326 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  31.65 
 
 
317 aa  122  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  28.95 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3032  hypothetical protein  30.41 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  30.42 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  29.15 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3386  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  30.41 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  31.25 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  29.02 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  31.62 
 
 
338 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  29.37 
 
 
326 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  32.14 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  28.18 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1849  hypothetical protein  28.98 
 
 
329 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.210601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0610  hypothetical protein  31.63 
 
 
317 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417146  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  30.82 
 
 
318 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  27.33 
 
 
327 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  31.02 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  31.82 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  28.95 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0164  hypothetical protein  31.34 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  31.34 
 
 
329 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  26.97 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  30.63 
 
 
322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  30.66 
 
 
326 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  26.97 
 
 
323 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  32.21 
 
 
330 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  31.71 
 
 
328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  31.51 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21240  hypothetical protein  31.01 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00058939  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  29.58 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  31.51 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0295  hypothetical protein  28.72 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1846  hypothetical protein  30.79 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0246944  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  30.88 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  30.15 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  31.58 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  29.27 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  27.81 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  29.78 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  29.9 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  28.27 
 
 
324 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  31 
 
 
329 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  30.1 
 
 
322 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  29.27 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5776  hypothetical protein  32.59 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  31.56 
 
 
328 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  31.85 
 
 
348 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  31.87 
 
 
334 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  30.14 
 
 
328 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  29.14 
 
 
330 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  31.76 
 
 
328 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  31.42 
 
 
336 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  30.48 
 
 
332 aa  112  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  28.97 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  30.21 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>