More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3032 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3386  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  99.69 
 
 
318 aa  642    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3032  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  54.02 
 
 
327 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  46.37 
 
 
323 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  31.12 
 
 
322 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  32.8 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  33.84 
 
 
327 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  35.31 
 
 
328 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  34.97 
 
 
328 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1565  hypothetical protein  34.13 
 
 
324 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  31.75 
 
 
336 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  33.22 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  29.11 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  31.89 
 
 
323 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  31.62 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3088  hypothetical protein  34.47 
 
 
322 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  31.18 
 
 
333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  31.7 
 
 
319 aa  145  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  29.19 
 
 
327 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  30.94 
 
 
325 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  30.94 
 
 
327 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  29.73 
 
 
333 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  30.94 
 
 
320 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  30.8 
 
 
328 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  34.01 
 
 
326 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  31.67 
 
 
330 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  31.6 
 
 
327 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  31.54 
 
 
330 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  30.51 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  31.27 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  28.88 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  35.61 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  30.07 
 
 
316 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  30.61 
 
 
321 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  30.03 
 
 
329 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  30.5 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  31.08 
 
 
327 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  30.64 
 
 
339 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  32.82 
 
 
325 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  33.84 
 
 
328 aa  139  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  31.75 
 
 
321 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  30.6 
 
 
325 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  30.5 
 
 
330 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  31.38 
 
 
324 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  31.38 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  29 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  31.38 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  31.35 
 
 
331 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  31.33 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  29.84 
 
 
331 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  31.25 
 
 
334 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  30.77 
 
 
320 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  30 
 
 
325 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  29.66 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  33.02 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  28.94 
 
 
330 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  29.96 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  34.27 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  32.7 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  30.55 
 
 
332 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  33.73 
 
 
333 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  34.29 
 
 
315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4274  hypothetical protein  30.8 
 
 
318 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0445604  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  32.32 
 
 
329 aa  133  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  29.11 
 
 
327 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  32.75 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  29.47 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  31.03 
 
 
325 aa  132  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  30.46 
 
 
320 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  30.54 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  31.23 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  29.14 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  30.48 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  32.83 
 
 
353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  30.39 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  29.66 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  31.01 
 
 
335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  30.3 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  30.13 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  31.65 
 
 
347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  31.56 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  33.21 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  32.52 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  32.83 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  28.81 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  31.23 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  30.13 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  31.64 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  29.29 
 
 
339 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  32.61 
 
 
318 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  29.9 
 
 
329 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  30.38 
 
 
327 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  28.57 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  30.64 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  30.9 
 
 
330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  29.87 
 
 
329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  28.03 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  32.82 
 
 
324 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>