More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0610 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0610  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  634    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417146  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  44.63 
 
 
335 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  42.41 
 
 
330 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  44.22 
 
 
335 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  38.57 
 
 
330 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0073  hypothetical protein  37.5 
 
 
334 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485967  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  34.71 
 
 
325 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  33.88 
 
 
325 aa  188  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  37.46 
 
 
328 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  39.93 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  35.62 
 
 
324 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  35.62 
 
 
324 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  35.62 
 
 
324 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  34.4 
 
 
326 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  35.81 
 
 
326 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  37.54 
 
 
331 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  32.19 
 
 
323 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  33.9 
 
 
325 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  32.83 
 
 
327 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.01 
 
 
327 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.56 
 
 
358 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  31.6 
 
 
333 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  36.33 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  37.22 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  35.2 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  32.9 
 
 
326 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  34.85 
 
 
318 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  29.81 
 
 
327 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  31.14 
 
 
322 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.52 
 
 
326 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  31.08 
 
 
331 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  38.26 
 
 
353 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  36.06 
 
 
326 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  33.66 
 
 
327 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  34 
 
 
332 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  30.85 
 
 
320 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  35.77 
 
 
324 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  36.07 
 
 
326 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  38.26 
 
 
328 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0596  hypothetical protein  30.67 
 
 
346 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.096367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5298  hypothetical protein  34.25 
 
 
314 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  31.31 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  35.62 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  34.03 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  32.9 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  31.83 
 
 
322 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  36.3 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  32.59 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  34.72 
 
 
340 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  36.86 
 
 
321 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  33.81 
 
 
333 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  35 
 
 
329 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 
328 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  35.34 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  36.57 
 
 
325 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  31.63 
 
 
315 aa  136  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  35.54 
 
 
356 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  36.57 
 
 
327 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  34.75 
 
 
356 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  29.39 
 
 
335 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  36.68 
 
 
325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.39 
 
 
329 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  31.97 
 
 
321 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  33.11 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  31.48 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  32.62 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  36.12 
 
 
333 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  33.2 
 
 
338 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  31.83 
 
 
325 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  33.83 
 
 
337 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  27.27 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  34.62 
 
 
310 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  33.7 
 
 
327 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  29.97 
 
 
328 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  35.91 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1257  hypothetical protein  31.45 
 
 
323 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  35.89 
 
 
318 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  32.99 
 
 
318 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  36.65 
 
 
322 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  31.42 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  34.15 
 
 
322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  31.56 
 
 
330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  32.95 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  34.12 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  33.58 
 
 
350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  36.36 
 
 
323 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  27.1 
 
 
318 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  33.09 
 
 
325 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  30.95 
 
 
325 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  35.63 
 
 
327 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  33.09 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  33.58 
 
 
324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  31.39 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  33.85 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  35.11 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  31.33 
 
 
332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>