More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1755 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  660    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  65.71 
 
 
325 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  49.24 
 
 
335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  51.01 
 
 
330 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  51.01 
 
 
335 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  49.83 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0073  hypothetical protein  45.45 
 
 
334 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  38.36 
 
 
328 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  45.76 
 
 
320 aa  222  6e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  34.91 
 
 
324 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  34.91 
 
 
324 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  34.91 
 
 
324 aa  185  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  33 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  34.06 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0610  hypothetical protein  34.71 
 
 
317 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417146  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  34.23 
 
 
318 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  34.37 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  31.58 
 
 
346 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  33.85 
 
 
331 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  32.66 
 
 
350 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  29.13 
 
 
336 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  33.44 
 
 
321 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  31.54 
 
 
335 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  29.97 
 
 
329 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  32.23 
 
 
324 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  30.82 
 
 
332 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  29.54 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  29.01 
 
 
322 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  29.14 
 
 
329 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  29.97 
 
 
325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  30.43 
 
 
334 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  29 
 
 
325 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  30.72 
 
 
326 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  32.03 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  29.64 
 
 
336 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  34.34 
 
 
325 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  30.36 
 
 
337 aa  145  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  30.99 
 
 
326 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  33.69 
 
 
328 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  27.55 
 
 
328 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  33.45 
 
 
327 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  33.22 
 
 
337 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  32 
 
 
338 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  31.79 
 
 
333 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  30.2 
 
 
323 aa  143  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  29.97 
 
 
330 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  30.46 
 
 
330 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  31.03 
 
 
340 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  30.12 
 
 
332 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  30.33 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  27.59 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  32.34 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  31.29 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  30.09 
 
 
322 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  30.42 
 
 
340 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  29.67 
 
 
332 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  29.35 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  30.49 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0143  hypothetical protein  32.85 
 
 
324 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  28.9 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  31.77 
 
 
334 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  32.85 
 
 
324 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  28.9 
 
 
328 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  29.14 
 
 
327 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  31.77 
 
 
328 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  29.14 
 
 
326 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  28.62 
 
 
339 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  30.94 
 
 
333 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  32.08 
 
 
318 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  30.92 
 
 
333 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4218  hypothetical protein  32.82 
 
 
317 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6086  hypothetical protein  30.43 
 
 
338 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  29.75 
 
 
336 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  29.27 
 
 
325 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  30.84 
 
 
323 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  32.17 
 
 
332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  30 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  29.56 
 
 
320 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  29.23 
 
 
325 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  31.78 
 
 
336 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  30.03 
 
 
325 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  28.22 
 
 
346 aa  136  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  28.95 
 
 
355 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  34.5 
 
 
398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  28.84 
 
 
331 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  29.65 
 
 
318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  30.65 
 
 
329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1758  hypothetical protein  29.37 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6149  extra-cytoplasmic solute receptor protein Bug family  33.99 
 
 
339 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.873662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  29.84 
 
 
334 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  29.61 
 
 
358 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  29.43 
 
 
343 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  31.33 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  31.19 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  29.85 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  28.35 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  29.73 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  28.22 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  28.86 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>