More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0073 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0073  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  673    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485967  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  46.82 
 
 
325 aa  288  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  41.92 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  45.05 
 
 
335 aa  279  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  46.78 
 
 
330 aa  278  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  46.96 
 
 
335 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  46.28 
 
 
330 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  38.39 
 
 
320 aa  199  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  36.24 
 
 
328 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0610  hypothetical protein  36.86 
 
 
317 aa  186  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417146  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  29.25 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  30.22 
 
 
324 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  30.22 
 
 
324 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  28.7 
 
 
356 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  29.85 
 
 
324 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  33.67 
 
 
325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  28.75 
 
 
329 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  32.72 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  32.89 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  33.45 
 
 
333 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  32.05 
 
 
336 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  29.52 
 
 
351 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  31.99 
 
 
324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  32.14 
 
 
326 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  29.24 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  29.45 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  34.19 
 
 
327 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  31.75 
 
 
338 aa  126  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  28.76 
 
 
331 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  30.3 
 
 
321 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  30.3 
 
 
339 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  32.47 
 
 
332 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0291  hypothetical protein  29.43 
 
 
333 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  33.68 
 
 
328 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  32.68 
 
 
327 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  28.91 
 
 
331 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  29.93 
 
 
329 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4844  hypothetical protein  31.21 
 
 
322 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  28.57 
 
 
318 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  31.19 
 
 
322 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  25.76 
 
 
326 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  32.74 
 
 
332 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  29.84 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  31.97 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  34.85 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  31.8 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  27.33 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3438  hypothetical protein  30.98 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0699421  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1846  hypothetical protein  29.23 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0246944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  29.41 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  29.43 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  30.82 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  30.15 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  30.53 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  29.79 
 
 
330 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  34.17 
 
 
326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  28.04 
 
 
322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  32.34 
 
 
325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4550  hypothetical protein  31.54 
 
 
331 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  30.83 
 
 
325 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  29.84 
 
 
337 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  35.66 
 
 
328 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  30.97 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  32.53 
 
 
395 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  31.54 
 
 
332 aa  119  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0143  hypothetical protein  30 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  33.46 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  31.25 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  32.75 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  31.66 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  27.55 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  28.82 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  31.58 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  31.05 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  29.51 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  29 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  30.37 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  30.38 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  29.45 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  30.96 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  29.08 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  35.32 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  27.21 
 
 
346 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  30.59 
 
 
323 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  29.35 
 
 
334 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  29.06 
 
 
327 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  28.81 
 
 
325 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6149  extra-cytoplasmic solute receptor protein Bug family  30.34 
 
 
339 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.873662 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  29.13 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  29.72 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  29.43 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  31.66 
 
 
329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  29.97 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  28.43 
 
 
332 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  27.03 
 
 
323 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  32.08 
 
 
334 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  30.16 
 
 
327 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  29.23 
 
 
328 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  30.9 
 
 
327 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  27.21 
 
 
329 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>