More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4419 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  38.41 
 
 		 339 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  38.61 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  35.99 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  37.5 
 
 		 333 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  37.37 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  39.74 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  38.68 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  36.51 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  36.79 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.41 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  38.38 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  34.45 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  37.16 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.91 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  34.65 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  37.59 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  33.75 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  38.75 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  35.74 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  36.67 
 
 		 377 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  34.5 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  33.94 
 
 		 330 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  35.64 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.23 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  35.02 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  35.49 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  37.37 
 
 		 327 aa  175  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  34.8 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  33.65 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.42 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  35.23 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.38 
 
 		 328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  38.93 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.41 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  34.67 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  37.41 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.46 
 
 		 326 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  33.54 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  34.8 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.23 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  33.67 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4109  extra-cytoplasmic solute receptor  38.14 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  37.09 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  35.03 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  36.86 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  34.72 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  36.04 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  32.19 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  34.46 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  33.71 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  34.69 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  33.46 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  34.69 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  33.96 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  31.63 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  33.66 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0990  twin-arginine translocation pathway signal  36.19 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  34.24 
 
 		 325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.28 
 
 		 320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.91 
 
 		 356 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  33.01 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  34.54 
 
 		 358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  33.67 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  35.14 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  34.9 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  33.94 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  33.67 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  33.65 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  35.95 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  35.44 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  37.32 
 
 		 321 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4122  hypothetical protein  32.91 
 
 		 327 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  34.56 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.36 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  33.88 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  34.77 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  33.88 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  34.52 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  34.88 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  31.89 
 
 		 324 aa  162  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  35.9 
 
 		 310 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  35.66 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  32.58 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  31.74 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  32.31 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  31.96 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  35.16 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  33.67 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  37.73 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  34.5 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  33.87 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  34.46 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  33.55 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  35.57 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  34.32 
 
 		 333 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  34.33 
 
 		 323 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  33.79 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  30.95 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>