More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3516 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  60.62 
 
 
326 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  53.35 
 
 
326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  51.88 
 
 
350 aa  327  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  50.49 
 
 
324 aa  324  9e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  50.16 
 
 
324 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  50.16 
 
 
324 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  47.96 
 
 
322 aa  298  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  54.86 
 
 
340 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  41.99 
 
 
331 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  34.71 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  31.69 
 
 
325 aa  182  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  35.25 
 
 
323 aa  176  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  32.93 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  35.25 
 
 
335 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  35.2 
 
 
320 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  33.44 
 
 
318 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  34.49 
 
 
322 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  31.89 
 
 
330 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  34.67 
 
 
333 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.43 
 
 
327 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  33.11 
 
 
325 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  32.44 
 
 
330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.13 
 
 
329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  30.89 
 
 
320 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  33.02 
 
 
356 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  31.65 
 
 
318 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  33.22 
 
 
332 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  29.47 
 
 
335 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.8 
 
 
326 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  32.19 
 
 
330 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  31.8 
 
 
343 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  32.69 
 
 
318 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  34.53 
 
 
323 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  33.56 
 
 
321 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  31.87 
 
 
330 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.4 
 
 
328 aa  155  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  34.32 
 
 
314 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  31.76 
 
 
325 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  32.92 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  26.38 
 
 
333 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  31.65 
 
 
325 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  31.63 
 
 
322 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3566  hypothetical protein  31.42 
 
 
330 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00357296  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  36.26 
 
 
335 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  33.56 
 
 
343 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  34.95 
 
 
322 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  37.1 
 
 
319 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  32.2 
 
 
330 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.4 
 
 
327 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.4 
 
 
325 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  30.67 
 
 
337 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  34.48 
 
 
327 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  32.41 
 
 
333 aa  149  8e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  31.15 
 
 
337 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  31.68 
 
 
332 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  29.39 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0880  hypothetical protein  34.98 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  33.45 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  31.77 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0620  hypothetical protein  36.07 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3055  hypothetical protein  32.65 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150263  normal  0.0186232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  32.5 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  31.4 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  31.78 
 
 
336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  33.81 
 
 
331 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  31.77 
 
 
327 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  34.47 
 
 
323 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  33.77 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  30.47 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  31.17 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  31.53 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  34.07 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0990  twin-arginine translocation pathway signal  34.22 
 
 
332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242855  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  31.15 
 
 
332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 
330 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  34.11 
 
 
327 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  34.06 
 
 
328 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  32.01 
 
 
328 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  31.83 
 
 
333 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3410  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  32.3 
 
 
317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.523204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0645  hypothetical protein  32.43 
 
 
331 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  32.52 
 
 
322 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  30.47 
 
 
328 aa  145  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  31.43 
 
 
327 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  31.42 
 
 
356 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  34.11 
 
 
324 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  36.08 
 
 
333 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  31.08 
 
 
327 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  30.74 
 
 
328 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  30.79 
 
 
336 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  30.34 
 
 
332 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  31.21 
 
 
332 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  32.17 
 
 
322 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  30 
 
 
334 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  30.18 
 
 
344 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  32.48 
 
 
328 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  31.44 
 
 
325 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  34.59 
 
 
304 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>