More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0596 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0596  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  696    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.096367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  34.31 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3909  hypothetical protein  31.13 
 
 
330 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  36.63 
 
 
333 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0291  hypothetical protein  31.97 
 
 
333 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  33.33 
 
 
351 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  32.53 
 
 
332 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  30.03 
 
 
332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  36.73 
 
 
342 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  33.45 
 
 
317 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  32.99 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  31.58 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  35.82 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  34.6 
 
 
319 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  33.1 
 
 
317 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  31.65 
 
 
321 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  32.23 
 
 
325 aa  144  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  34.3 
 
 
347 aa  143  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  29.86 
 
 
318 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  31.42 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  34.6 
 
 
322 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  31.13 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  31.77 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  35.16 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  30.58 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  31.87 
 
 
331 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  31.6 
 
 
323 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  31.03 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  35.66 
 
 
332 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  32.59 
 
 
322 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  31.37 
 
 
320 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  32.47 
 
 
326 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  30.82 
 
 
333 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  33.07 
 
 
330 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  32.09 
 
 
349 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  33.97 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  30.48 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  30.27 
 
 
344 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  31.61 
 
 
346 aa  135  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  30.72 
 
 
335 aa  135  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  32.84 
 
 
327 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  30.26 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  30.26 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  30.38 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  32.31 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  29.84 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  29.87 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  29.72 
 
 
332 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  28.57 
 
 
332 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  29.35 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  33.98 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  27.93 
 
 
321 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  29.12 
 
 
318 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  30.51 
 
 
323 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3581  hypothetical protein  31.69 
 
 
331 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0733859  normal  0.0164081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  31.5 
 
 
328 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21240  hypothetical protein  33.09 
 
 
318 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00058939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  32.44 
 
 
327 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  33.57 
 
 
321 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  32.39 
 
 
326 aa  132  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  33.71 
 
 
324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  29.39 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  30.51 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  26.74 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  32.71 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4274  hypothetical protein  31.71 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0445604  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  31.64 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  32.88 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  33.08 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  29.55 
 
 
329 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  29.51 
 
 
322 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  29.03 
 
 
330 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  30.17 
 
 
337 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  30.56 
 
 
326 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  32.14 
 
 
323 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  31.58 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  32.19 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  30.94 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  37.21 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  28.75 
 
 
320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3496  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.192421 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2041  hypothetical protein  30.87 
 
 
320 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  30.33 
 
 
329 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  29.68 
 
 
328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  30.77 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  29.61 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  31.56 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  31.27 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  32.56 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  31.49 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  33.71 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  32.69 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  28.33 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  35.04 
 
 
359 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  30.79 
 
 
326 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  29.53 
 
 
326 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  32.31 
 
 
323 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  29.32 
 
 
329 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  30.83 
 
 
328 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>