More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2221 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2221  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3011  twin-arginine translocation pathway signal  84.97 
 
 		 330 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4284  hypothetical protein  63.58 
 
 		 335 aa  428  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4541  hypothetical protein  65.67 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2514  hypothetical protein  51.08 
 
 		 325 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1755  hypothetical protein  50.65 
 
 		 325 aa  325  6e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0073  hypothetical protein  46.2 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3968  hypothetical protein  45.03 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2441  hypothetical protein  46.82 
 
 		 320 aa  242  7.999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0610  hypothetical protein  43.45 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417146  normal  0.0239615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  34.54 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  34.54 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  34.54 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  36.39 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  34.92 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  36.3 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  35.25 
 
 		 318 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  32.62 
 
 		 351 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  34.39 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  35.24 
 
 		 320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.23 
 
 		 327 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  33.91 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  35.09 
 
 		 322 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.94 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.12 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  36.14 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  36.27 
 
 		 320 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.74 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  32.78 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  37.32 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  34.26 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  35.94 
 
 		 336 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  33.84 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  35.56 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  34.52 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  35.23 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  32.31 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  36.45 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  33.55 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  37.27 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  32.41 
 
 		 324 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  33.44 
 
 		 331 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  33.55 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  34.15 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  34.01 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  35.76 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  34.65 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0826  hypothetical protein  29.71 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  37.2 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  31.44 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  34.82 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  29.62 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  34.85 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.64 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  31.44 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  33 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  35.18 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  35.33 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  34.6 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  37.36 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  35.63 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  33.68 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  33.99 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  33.87 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  35.33 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  35.33 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  34.43 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  32.62 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  34.97 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2118  hypothetical protein  32.72 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0299117  normal  0.0185863 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  35.43 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  33.01 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  36.8 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  35.34 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  33.77 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  32.78 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  28.92 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  34.52 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  32.65 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  34.59 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  32.19 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  31.44 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  35.62 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4274  hypothetical protein  33.67 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  32.21 
 
 		 336 aa  145  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  36.93 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  32.32 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  34.06 
 
 		 331 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  32.81 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  35.18 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  30.5 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  34.21 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  35.33 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  31.06 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  34.69 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>