More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1767 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  672    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3032  hypothetical protein  54.02 
 
 
318 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3386  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  54.02 
 
 
318 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  42.91 
 
 
323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  33.68 
 
 
322 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  30.82 
 
 
327 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  33.78 
 
 
320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  32.01 
 
 
319 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  34.28 
 
 
325 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  31.99 
 
 
320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  33.01 
 
 
333 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  33.71 
 
 
323 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  33.58 
 
 
326 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  29.87 
 
 
327 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  29.39 
 
 
328 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  29.87 
 
 
325 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  30.24 
 
 
333 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  29.39 
 
 
328 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  31.21 
 
 
331 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  32.04 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  30.45 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  30.45 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  32 
 
 
326 aa  146  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  29.87 
 
 
333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  31.18 
 
 
329 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  29.51 
 
 
328 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  30.8 
 
 
329 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  28.88 
 
 
328 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2136  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  31.35 
 
 
323 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.961673 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  31.53 
 
 
330 aa  143  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  29.05 
 
 
327 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  29.57 
 
 
327 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  28.47 
 
 
316 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1059  hypothetical protein  31.69 
 
 
315 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0448256  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  29.77 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  30.62 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  28.57 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  28.71 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  27.95 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  30.84 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  30.03 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  31.91 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  31.68 
 
 
328 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  31.68 
 
 
353 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  28.62 
 
 
324 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  28.8 
 
 
321 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  29.02 
 
 
332 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  30.72 
 
 
323 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  26.98 
 
 
327 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  29.49 
 
 
330 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  27.58 
 
 
322 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  32.81 
 
 
326 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  29.6 
 
 
331 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  29.87 
 
 
330 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  29.85 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  28.9 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  27.6 
 
 
319 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  32.5 
 
 
322 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  27.93 
 
 
356 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  27.36 
 
 
329 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  28.48 
 
 
320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  31.03 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  31.63 
 
 
336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1073  hypothetical protein  28.12 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988493  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  29.63 
 
 
327 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  27.91 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  29.19 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  29.07 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  27.65 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  29.47 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  29.69 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  26.97 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  26.73 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  27.8 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  28.87 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  27.8 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  29.62 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  29.43 
 
 
321 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  34.09 
 
 
323 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  29.97 
 
 
321 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  31.79 
 
 
334 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  29.73 
 
 
336 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  29.35 
 
 
316 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  27.55 
 
 
328 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  28.57 
 
 
333 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  29.25 
 
 
337 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  28.57 
 
 
322 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  31.43 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  28.35 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  27.65 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  29.19 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  27.57 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  29.22 
 
 
328 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  30.42 
 
 
322 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  29.49 
 
 
342 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1077  hypothetical protein  33.07 
 
 
317 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  29.04 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  30.58 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  29.77 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>