More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1433 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 323 aa  663    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3032  hypothetical protein  44.55 
 
 		 318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3386  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  44.55 
 
 		 318 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  41.96 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  30.96 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  32.44 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  32.08 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  32.26 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  31.73 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  30.28 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  34.8 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  34.31 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  30.28 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  33.22 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  33.08 
 
 		 328 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  32.98 
 
 		 327 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  33.21 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  32.31 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  29.52 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  29.27 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  30.77 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  29.71 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  29.28 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  29.12 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  29.2 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  27.49 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  31.02 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  25.84 
 
 		 326 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  29.73 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  30.04 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  30.74 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  29.97 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  30.14 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  32.06 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5356  extra-cytoplasmic solute receptor  31.07 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  28.42 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  30.18 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  29.53 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  28.99 
 
 		 358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  29.18 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  31.37 
 
 		 352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  29 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  31.06 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  31.06 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  27.55 
 
 		 320 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  31.19 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  29.43 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  30.13 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  31.42 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  31.01 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  29.58 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  29.15 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.82 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  27.83 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  29.57 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3092  hypothetical protein  26.39 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.23333  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  30.94 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  26.67 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  28.36 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2376  hypothetical protein  28.51 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  28.04 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  30.34 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  30.34 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  29.68 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  29.47 
 
 		 330 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  32.24 
 
 		 332 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  32.05 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  29.73 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  29.45 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  28.85 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1565  hypothetical protein  30 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  29.45 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  29.68 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  33.45 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  29.9 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  29.63 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  30.47 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  29.63 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  28.07 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0833  hypothetical protein  29.05 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000608571  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  29.63 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  29.9 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  29.12 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0911  hypothetical protein  32.38 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  28.89 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  28.89 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3823  hypothetical protein  28.27 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  30.37 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  29.37 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  30.27 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  29.66 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  28.23 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  28.67 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  28.47 
 
 		 339 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  27.55 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  29.37 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  30.18 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>