More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3092 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3092  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  646    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.23333  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  55.63 
 
 		 326 aa  322  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3088  hypothetical protein  46.44 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  33.58 
 
 		 330 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  37.73 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  31.46 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  35.85 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  32.96 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  35.45 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  35.07 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0989  hypothetical protein  35.52 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  34.04 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  34.51 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  34.81 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  35.42 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.8 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  34.62 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0904  hypothetical protein  35.14 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.940206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  35.79 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  32 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  33.58 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  34.08 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  34.65 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  33.58 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  35.88 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  35.88 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  35.34 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  35.71 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  34.21 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3457  hypothetical protein  35.83 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0058  hypothetical protein  34.09 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  32.42 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  33.21 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  31.54 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0026  hypothetical protein  33.58 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  33.96 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  32.65 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  33.57 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  36.1 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  32.29 
 
 		 324 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  35.77 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  32.2 
 
 		 331 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  33.67 
 
 		 328 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  31.6 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.79 
 
 		 328 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  33.97 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  33.09 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.09 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  31.6 
 
 		 328 aa  142  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  32.27 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  34 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  35.34 
 
 		 339 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  31.05 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  32.48 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  31.1 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  31.76 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  32.66 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  31.97 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  33.68 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  35.58 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  34.84 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  33.46 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  32.6 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  31.14 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  32.83 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  32.83 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  30.2 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  33.21 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  29.25 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  31.94 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  31.99 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  33.7 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  32.95 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  32.44 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  34.47 
 
 		 386 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  33.68 
 
 		 318 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  32.55 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  33.22 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3320  hypothetical protein  33.11 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449254  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  33.09 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  33.08 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  31.86 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  31.15 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  28.71 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  32.02 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3493  hypothetical protein  28.75 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103315 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  35.58 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  30.37 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  34.73 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  30.82 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  32.96 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3258  hypothetical protein  35.92 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0738365  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  31.49 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4804  hypothetical protein  35.43 
 
 		 350 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.589881  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  33.11 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  32.89 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  32.26 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  34.22 
 
 		 322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  33.44 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>