More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3320 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3320  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449254  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1884  hypothetical protein  60.62 
 
 
323 aa  347  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.86 
 
 
325 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.8 
 
 
328 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.49 
 
 
328 aa  255  9e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 
328 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.36 
 
 
339 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  42.77 
 
 
324 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.46 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.82 
 
 
327 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.51 
 
 
328 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  40.31 
 
 
330 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.69 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.39 
 
 
324 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.45 
 
 
336 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.27 
 
 
330 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  39.44 
 
 
334 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  41.4 
 
 
356 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  38.78 
 
 
326 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  40.65 
 
 
322 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.75 
 
 
334 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.25 
 
 
332 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.37 
 
 
328 aa  225  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  41.55 
 
 
328 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.2 
 
 
336 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.44 
 
 
330 aa  225  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.46 
 
 
330 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.93 
 
 
325 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.97 
 
 
322 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  40.86 
 
 
324 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.94 
 
 
318 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  42.47 
 
 
336 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  42.61 
 
 
328 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.73 
 
 
327 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.73 
 
 
325 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  40.73 
 
 
326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  39.1 
 
 
327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  41.81 
 
 
361 aa  222  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  42.56 
 
 
325 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.51 
 
 
323 aa  221  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.05 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.29 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  40.4 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.67 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.23 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  41.42 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  38.85 
 
 
325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  39.76 
 
 
326 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  42.36 
 
 
324 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  38.98 
 
 
335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.62 
 
 
339 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.25 
 
 
356 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  35.99 
 
 
343 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39.79 
 
 
337 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  39.67 
 
 
333 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.33 
 
 
351 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  36.59 
 
 
322 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.01 
 
 
332 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  38.64 
 
 
325 aa  218  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.2 
 
 
328 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  38.73 
 
 
344 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.33 
 
 
314 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  36.27 
 
 
322 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.46 
 
 
328 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.54 
 
 
345 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38.98 
 
 
310 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  40 
 
 
344 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.5 
 
 
325 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  40.13 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  41.28 
 
 
386 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4275  hypothetical protein  42.28 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914627  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.54 
 
 
345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.5 
 
 
332 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.13 
 
 
324 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.33 
 
 
330 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.33 
 
 
330 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  37.95 
 
 
322 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40.74 
 
 
360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.24 
 
 
344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  38.76 
 
 
339 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.44 
 
 
339 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.59 
 
 
322 aa  215  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.18 
 
 
335 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.78 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  38.31 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.12 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  38.36 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  38.83 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.62 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.85 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  39.43 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.05 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  37.14 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  40.07 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  37.46 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  40.26 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  40.07 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.82 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.26 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>