More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3088 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3088  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  50.33 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3092  hypothetical protein  45.65 
 
 		 328 aa  261  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.23333  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1712  hypothetical protein  36.53 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407863  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  36.97 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  34.86 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  36.75 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  36.66 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  33.57 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  35.22 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  33.45 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  31.25 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  35.17 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.37 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.37 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.7 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  34.29 
 
 		 343 aa  146  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  33.9 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  34.69 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  32.61 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  33.1 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0753  hypothetical protein  31.89 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  32.61 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  35.06 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3386  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  34.81 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  36.92 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  35.63 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  34.81 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  34.8 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3032  hypothetical protein  34.47 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  33.08 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.63 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  34.15 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.11 
 
 		 330 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  35.16 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  33.11 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  33.44 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  30.35 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  32.03 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  39.1 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  32.03 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  37.94 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  28.66 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  34.41 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  32.03 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  33.58 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4804  hypothetical protein  37.01 
 
 		 350 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.589881  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  34.78 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  32.95 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  32.34 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  36.06 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  34.38 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  35.36 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  33.83 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  35.45 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  32.87 
 
 		 331 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  33.86 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  31.29 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  33.99 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  34.78 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  39.75 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.31 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.1 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  34.98 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.63 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  33.23 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  30.1 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  30.25 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  34.25 
 
 		 317 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  32.82 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  33.81 
 
 		 341 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5830  hypothetical protein  35.96 
 
 		 339 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  35.19 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  35.83 
 
 		 331 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  34.93 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4341  extra-cytoplasmic solute receptor  33.22 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  32.31 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  35.06 
 
 		 328 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  32.71 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  33.58 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.76 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  34.39 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3886  hypothetical protein  33.78 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576729  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  32.07 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  32.97 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  30.24 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3819  hypothetical protein  30.77 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  33.58 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  36.36 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1767  hypothetical protein  29.2 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0125693  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  32.65 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  34.59 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  31.73 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  28.81 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>