More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4614 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  311  6.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0715  hypothetical protein  51.99 
 
 		 323 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  43.75 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  39.81 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  41.64 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.13 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  40.06 
 
 		 371 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  42.38 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  40.06 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  42.05 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.27 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  41.03 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.55 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.74 
 
 		 328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  39.88 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.87 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.56 
 
 		 325 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  39.25 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.69 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  41.14 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.59 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.33 
 
 		 339 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.18 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.94 
 
 		 336 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  40.44 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.05 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  41.19 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  40.26 
 
 		 320 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.56 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.34 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.26 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.54 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.13 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.02 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  38.66 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  38.17 
 
 		 338 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.38 
 
 		 337 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.19 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.84 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.2 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  40.2 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  38.61 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.62 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.41 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.46 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.18 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.83 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.46 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  38.24 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.1 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.1 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  37.12 
 
 		 334 aa  222  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.32 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0645  hypothetical protein  40.21 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.07 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.58 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.86 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  35.31 
 
 		 343 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.09 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.42 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  40.2 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.54 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  41.28 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.97 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  40.45 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  36.16 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.19 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  38.8 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  36.39 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  37.3 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  38 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  38.31 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  37.97 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  38.46 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.84 
 
 		 330 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.88 
 
 		 330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1763  hypothetical protein  38.39 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  38.87 
 
 		 360 aa  215  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.58 
 
 		 325 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  39.53 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.91 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  39.8 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  34.22 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.7 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  37.86 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  37.92 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  37.11 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  36.33 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  37.54 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  37.85 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  38.34 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.26 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0621  hypothetical protein  40.2 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.87 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.54 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.87 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  35.74 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>