More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0715 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0715  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  650    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  51.84 
 
 		 322 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  47.1 
 
 		 338 aa  277  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  37.12 
 
 		 326 aa  215  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.06 
 
 		 327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  38.85 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  42.91 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.77 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.28 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  38.75 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  37.46 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  42.55 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  37.81 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  38.44 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  39.32 
 
 		 332 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.48 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.48 
 
 		 335 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  35.95 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.11 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  37.25 
 
 		 371 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.77 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.45 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  38.87 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.18 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  35.81 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.46 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.49 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  34.65 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  37.58 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  36.52 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  35.76 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  35.29 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.66 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  33.75 
 
 		 327 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  36.64 
 
 		 321 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.37 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.37 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  35.29 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.67 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  39.1 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3438  hypothetical protein  37.5 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0699421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.49 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  35.94 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  36.7 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  37.26 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  37.98 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.58 
 
 		 334 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.28 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  39.12 
 
 		 332 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  37.91 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.11 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  36.95 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.91 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  40.6 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  40.15 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  34.93 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.27 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  37.38 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  37.63 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  34.93 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.97 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  34.7 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  35.92 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  35.4 
 
 		 322 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  39.64 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.68 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  36.91 
 
 		 322 aa  189  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.38 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  37 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  35.37 
 
 		 327 aa  188  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4413  hypothetical protein  38.93 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.57 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0621  hypothetical protein  38.01 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  39.41 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  36.09 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4626  hypothetical protein  35.59 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  34.74 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  34.48 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37.5 
 
 		 345 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  35.43 
 
 		 332 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  36.99 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.5 
 
 		 345 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  35.55 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  35.35 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2041  hypothetical protein  36.36 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.99 
 
 		 332 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  37.04 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  34.26 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  36.69 
 
 		 330 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  34.29 
 
 		 344 aa  185  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  35.52 
 
 		 330 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  34.01 
 
 		 341 aa  185  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  34.01 
 
 		 344 aa  185  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3341  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  185  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0035025  normal  0.828931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>