More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4626 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4626  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  42.63 
 
 
330 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  40.35 
 
 
383 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.67 
 
 
339 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.67 
 
 
331 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.55 
 
 
327 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.12 
 
 
336 aa  231  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.87 
 
 
330 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  41.38 
 
 
323 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.13 
 
 
341 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.48 
 
 
322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  36.79 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  40.44 
 
 
341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.24 
 
 
326 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.14 
 
 
327 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.3 
 
 
325 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.6 
 
 
328 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  37.46 
 
 
332 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  36.31 
 
 
336 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.46 
 
 
332 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  37.54 
 
 
325 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  38.99 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.54 
 
 
322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.61 
 
 
345 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.61 
 
 
345 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.63 
 
 
330 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  36.56 
 
 
330 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.16 
 
 
328 aa  215  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  38.8 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.88 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.72 
 
 
324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.29 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  40.41 
 
 
329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0485  hypothetical protein  37.5 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  39.49 
 
 
330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.05 
 
 
318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.7 
 
 
333 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.6 
 
 
358 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.88 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  39.39 
 
 
338 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.27 
 
 
330 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.79 
 
 
334 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.97 
 
 
331 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  37.34 
 
 
332 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  38.34 
 
 
698 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  36.18 
 
 
325 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  36.18 
 
 
325 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 
347 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.25 
 
 
327 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  39.94 
 
 
327 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.58 
 
 
328 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.58 
 
 
328 aa  208  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.82 
 
 
333 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  39.73 
 
 
331 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.63 
 
 
331 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  36.82 
 
 
324 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.8 
 
 
332 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1324  hypothetical protein  37.11 
 
 
337 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00138921  hitchhiker  3.8453799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  35.53 
 
 
323 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  38.33 
 
 
337 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  36.03 
 
 
321 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  38.28 
 
 
343 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  38.03 
 
 
333 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  37.71 
 
 
326 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  36.33 
 
 
338 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  36.66 
 
 
331 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  38.11 
 
 
360 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  36.61 
 
 
328 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  36.39 
 
 
323 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.38 
 
 
328 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  36.67 
 
 
330 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  35.53 
 
 
333 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  34.88 
 
 
337 aa  205  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  37.62 
 
 
331 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.54 
 
 
314 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  37.62 
 
 
322 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  37.29 
 
 
337 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.99 
 
 
349 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  37.5 
 
 
335 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  34.92 
 
 
326 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  36.18 
 
 
332 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  37.88 
 
 
333 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  37.33 
 
 
322 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  38.59 
 
 
334 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  39.86 
 
 
322 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  36.42 
 
 
321 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.12 
 
 
348 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.51 
 
 
333 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2501  hypothetical protein  38.46 
 
 
322 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  35.56 
 
 
330 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  37.06 
 
 
333 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  34.19 
 
 
332 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  39.07 
 
 
330 aa  202  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  37.85 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.39 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  35.91 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  38.33 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  36.56 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1351  Fis family transcriptional regulator  37.76 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.148208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>