More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3258 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3258  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0738365  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  46.49 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  45.71 
 
 		 333 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  44.33 
 
 		 334 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  43.33 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.36 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.12 
 
 		 326 aa  245  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  40.73 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  43.71 
 
 		 314 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  40.18 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.73 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  40.5 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  41.94 
 
 		 346 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  42.09 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.86 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.21 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  37.96 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0485  hypothetical protein  41.55 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.67 
 
 		 328 aa  211  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.18 
 
 		 348 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.67 
 
 		 328 aa  211  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.53 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.38 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.58 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  40.07 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  40.24 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.88 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2965  hypothetical protein  41.22 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  41.07 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.89 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  40.21 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.12 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.12 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  39.94 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  39.2 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.06 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.74 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.67 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.4 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.8 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  37.15 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.2 
 
 		 327 aa  205  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  40.44 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  37.12 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.2 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  39.38 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.65 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.77 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.07 
 
 		 336 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0226  hypothetical protein  40.33 
 
 		 327 aa  202  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  36.84 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  35.91 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  36.65 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  38.08 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.97 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0840  hypothetical protein  36.22 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.54 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.26 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.62 
 
 		 327 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  37.83 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.32 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  33.95 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  38.44 
 
 		 344 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  37.39 
 
 		 336 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  37.62 
 
 		 324 aa  199  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1324  hypothetical protein  36.56 
 
 		 337 aa  199  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00138921  hitchhiker  3.8453799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.46 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.32 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  38.51 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  36.86 
 
 		 336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.67 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  36.96 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  38.41 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  36.58 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3438  hypothetical protein  38.91 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0699421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6115  hypothetical protein  39.73 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  39.93 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  38.82 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  35.83 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  36.68 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.01 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  38.58 
 
 		 335 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  38.32 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  38.85 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  38.51 
 
 		 353 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5776  hypothetical protein  41.22 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.11 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.04 
 
 		 325 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.04 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.83 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.49 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  37.42 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.49 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  37.38 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  34.65 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  36.82 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  39.32 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.53 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  36.31 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>