More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0485 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0485  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1324  hypothetical protein  83.98 
 
 		 337 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00138921  hitchhiker  3.8453799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1056  hypothetical protein  61.29 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.69 
 
 		 331 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  40.98 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.96 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.3 
 
 		 328 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.28 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  37.85 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5038  extra-cytoplasmic solute receptor  39.03 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  39.86 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  39.75 
 
 		 321 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  38.14 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  42.16 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.24 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  39.66 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.48 
 
 		 335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.81 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.81 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.24 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.68 
 
 		 328 aa  221  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  37.69 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.68 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  39.49 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1019  hypothetical protein  39.6 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  39.02 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.19 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  40.75 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  38.73 
 
 		 344 aa  219  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.88 
 
 		 334 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.69 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  37.19 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.86 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  37.54 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.72 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.96 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.75 
 
 		 349 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.07 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  37.46 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  40.71 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2907  hypothetical protein  37.84 
 
 		 327 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  40.21 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  38.12 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  36.84 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.47 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  39.79 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.66 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  39.79 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.42 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  39.38 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4626  hypothetical protein  37.5 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  41.78 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.26 
 
 		 332 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  36.77 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.18 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  35.56 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  37.38 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.84 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  38.97 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  34.94 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.85 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  39.33 
 
 		 341 aa  208  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  37.32 
 
 		 323 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  37.59 
 
 		 343 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  38.62 
 
 		 345 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.03 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.33 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  39.22 
 
 		 366 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  38.3 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.31 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.6 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  41.78 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.04 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  38.82 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  36.49 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  36.88 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.42 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.67 
 
 		 344 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.01 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  40.84 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  36.67 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  37.76 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.34 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.97 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  37.12 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  36.28 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  39.19 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.94 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3258  hypothetical protein  41.5 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0738365  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  37.29 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4453  hypothetical protein  38.44 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.18 
 
 		 337 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  38.46 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  38.81 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.66 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3141  hypothetical protein  36.62 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.78 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  36.09 
 
 		 330 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  38.33 
 
 		 337 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>