More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1324 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1324  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  673    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00138921  hitchhiker  3.8453799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0485  hypothetical protein  83.98 
 
 		 333 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1056  hypothetical protein  61.24 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.16 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.96 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  39.52 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  39.63 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.41 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  39.45 
 
 		 326 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.58 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.59 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.58 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  39.62 
 
 		 324 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5038  extra-cytoplasmic solute receptor  38.14 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.7 
 
 		 356 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.22 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  36.09 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  36.75 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.22 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.58 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  39.02 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  39.72 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.59 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  39.86 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  35.54 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  38.38 
 
 		 344 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  38.7 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4626  hypothetical protein  37.11 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  37.2 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.38 
 
 		 328 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  37.38 
 
 		 346 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.15 
 
 		 339 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  36.86 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  35.71 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.8 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.8 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.14 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  37.06 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2907  hypothetical protein  36.79 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.54 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  39.45 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  39.16 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.37 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  39.45 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  38.28 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1019  hypothetical protein  35.88 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  38.46 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  38.91 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.93 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  38.06 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.99 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  35.49 
 
 		 335 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  37.59 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  37.39 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  37.37 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.12 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  38.62 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  38.25 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.46 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  35.53 
 
 		 331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  36.81 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  36.33 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  37.66 
 
 		 334 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.27 
 
 		 344 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.05 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  35.31 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  36.68 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  36.21 
 
 		 339 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  35.08 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  37.41 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.78 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  37.66 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.51 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  37 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.44 
 
 		 330 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.33 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  33.23 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.66 
 
 		 358 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  35.74 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.33 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.67 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  36.58 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  36.75 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  37.88 
 
 		 474 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  35.2 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.49 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  34.04 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2488  hypothetical protein  35.14 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.572284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  35.81 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3258  hypothetical protein  36.47 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0738365  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  34.64 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  39.58 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  37.88 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6149  extra-cytoplasmic solute receptor protein Bug family  33.45 
 
 		 339 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.873662 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  38.01 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  36.7 
 
 		 322 aa  192  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  34.04 
 
 		 330 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>