More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2124 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2124  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  100 
 
 		 316 aa  634    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2136  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  56.76 
 
 		 323 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2144  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  53.54 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2154  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  53.02 
 
 		 323 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.867826  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2138  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  55.7 
 
 		 321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2159  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  38.41 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461923  normal  0.630162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.33 
 
 		 327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  36.91 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.29 
 
 		 338 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.49 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.49 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  37.71 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.69 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.59 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.59 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  38.18 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.31 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.49 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.1 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.15 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  36.27 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.94 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.29 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.26 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  36.42 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.05 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  36.67 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.62 
 
 		 328 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.58 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.84 
 
 		 333 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  36.12 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.87 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5403  hypothetical protein  37.07 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.848586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  36.21 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  35.79 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  37.29 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  35.25 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  35.13 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  34.81 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  35.91 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.74 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  36.12 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  37.92 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  36.95 
 
 		 324 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  37.04 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  38.18 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.56 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  38.18 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1907  hypothetical protein  34.88 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.653438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.1 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  35.88 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  34.65 
 
 		 335 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  36.71 
 
 		 323 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  34.5 
 
 		 328 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  36.51 
 
 		 335 aa  188  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  35.91 
 
 		 337 aa  188  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.12 
 
 		 335 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.39 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1189  hypothetical protein  35.57 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  33 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.39 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  34.29 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.61 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  37.28 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  36.82 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1898  hypothetical protein  37.63 
 
 		 329 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3573  hypothetical protein  37.72 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  38.14 
 
 		 341 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 		 328 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  32.89 
 
 		 330 aa  185  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  35.95 
 
 		 364 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  34.71 
 
 		 358 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  33.86 
 
 		 322 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  32.89 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  34.23 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  34.29 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  34.92 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  36.92 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  34.45 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  34.8 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  34.5 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  39.4 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  38.91 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  34.11 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  37.37 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  35.41 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  35.23 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  37.29 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  35.71 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1006  twin-arginine translocation pathway signal  34.24 
 
 		 333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  34.45 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  33.11 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  38.85 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  33.66 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  33.45 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  35.59 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.75 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>