More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2154 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2154  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  100 
 
 		 323 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.867826  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2136  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  53.27 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2144  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  52.65 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2124  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  53.02 
 
 		 316 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2138  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  52.5 
 
 		 321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.28 
 
 		 325 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2159  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  39.56 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461923  normal  0.630162 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.59 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.81 
 
 		 318 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.69 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  40.5 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.61 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 323 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  43.29 
 
 		 336 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.32 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.69 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.54 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.54 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.38 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.05 
 
 		 358 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.78 
 
 		 325 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  39.41 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  39.73 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  40.86 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  40.27 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.64 
 
 		 338 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.26 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.87 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  36.83 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  36.11 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.78 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.78 
 
 		 325 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  39.61 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.42 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.98 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.56 
 
 		 328 aa  202  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.27 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  37.31 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.25 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  35.08 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  36.65 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  35.91 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  40.13 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  39.53 
 
 		 359 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  37.25 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.4 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.92 
 
 		 335 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  38.13 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.54 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.8 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  36.34 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.8 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.6 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.13 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  37.33 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.73 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  34.15 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  41.06 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.56 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.86 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4676  hypothetical protein  37.92 
 
 		 327 aa  196  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  35.96 
 
 		 334 aa  195  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.36 
 
 		 333 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  39.63 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.56 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.15 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  37.84 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  39.06 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.19 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  36.49 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  37.67 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  36.76 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  36.33 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  35.42 
 
 		 318 aa  192  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  39.53 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  37.87 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  38.46 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  38.01 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.1 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.1 
 
 		 335 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.29 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.62 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.29 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.92 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.73 
 
 		 339 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  36.12 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  38.44 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  40.07 
 
 		 330 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  39.32 
 
 		 330 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  36.42 
 
 		 324 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.91 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  37.35 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.16 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  38.46 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1522  hypothetical protein  33.44 
 
 		 326 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>