More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2138 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2138  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  100 
 
 		 321 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2144  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  61.06 
 
 		 330 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2136  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  56.39 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2124  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  55.7 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2154  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  53.9 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.867826  normal  0.321819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2159  tripartite tricarboxylate transporter(TTT) family, periplasmic ligand binding protein TctC  42.81 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.461923  normal  0.630162 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.12 
 
 		 325 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  37.81 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.67 
 
 		 336 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.27 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  39.39 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.19 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.19 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.2 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  38.72 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  37.92 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.72 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.11 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  37.62 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.59 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.88 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  37.79 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.12 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.71 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  37.12 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  35.85 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  37.33 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  38.92 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  40.37 
 
 		 330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  34.97 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.54 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.54 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  34.97 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.21 
 
 		 358 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  39.57 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.7 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  38.67 
 
 		 323 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  36.7 
 
 		 328 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  35.12 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.83 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  35.6 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  36.53 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  36.15 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  35.45 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.51 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.68 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  35.19 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.05 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.25 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  36.54 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  38.26 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  36.79 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  38.59 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  41.61 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.05 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  35.93 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  34.08 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  38.26 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  36.82 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.61 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  36 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  36.02 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.87 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  36.54 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  37.77 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  37.25 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.67 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  39.41 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.74 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  36.61 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5716  hypothetical protein  40.3 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  36.33 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  33.76 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.37 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.07 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  36.36 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  35.14 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  37.29 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  36.3 
 
 		 345 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  36.49 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.1 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  36.3 
 
 		 345 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  37.89 
 
 		 326 aa  190  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  34.11 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  35.84 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  38.23 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  36.36 
 
 		 331 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  36.79 
 
 		 355 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  35.46 
 
 		 328 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2769  hypothetical protein  40.23 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  35.9 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  35.91 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  35 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  40.21 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  34.41 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  37.25 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.58 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  38.36 
 
 		 336 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  33 
 
 		 324 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>