More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3683 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 326 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0962  hypothetical protein  70.86 
 
 		 325 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  67.07 
 
 		 328 aa  447  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4890  hypothetical protein  63 
 
 		 330 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.979482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3593  hypothetical protein  59.87 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1686  hypothetical protein  60.42 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3566  hypothetical protein  59.09 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00357296  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.46 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.76 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  43.09 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.09 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  39.82 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.09 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.09 
 
 		 329 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  39.7 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.94 
 
 		 325 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.94 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.1 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  47.31 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  43.38 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  42.76 
 
 		 323 aa  229  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  40.18 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.4 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  39.27 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.2 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.65 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  38.96 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  37.85 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  39.38 
 
 		 320 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.49 
 
 		 326 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  39.58 
 
 		 346 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.12 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  39.4 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.34 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.76 
 
 		 327 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  39.39 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.91 
 
 		 336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.69 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.13 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.18 
 
 		 351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.42 
 
 		 332 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.11 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  44.3 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  40.87 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  41.91 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.56 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.22 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  41.58 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  40.57 
 
 		 322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.52 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.52 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.73 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  40.92 
 
 		 360 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  40.06 
 
 		 322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  40.73 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.81 
 
 		 324 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  36.92 
 
 		 323 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  38.91 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.5 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  39.87 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.52 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.58 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.06 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.57 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.74 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  38.15 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.42 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.88 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  38.11 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.18 
 
 		 334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.66 
 
 		 314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.08 
 
 		 322 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  38.96 
 
 		 322 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.24 
 
 		 335 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  41.5 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.82 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  40.31 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  36.33 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  37.27 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.21 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  38.94 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  37.15 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  38.12 
 
 		 333 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  38.32 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.7 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  37.69 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.59 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  36.97 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  40.26 
 
 		 344 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  37.38 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.56 
 
 		 332 aa  208  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.54 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0157  twin-arginine translocation pathway signal  41.98 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  36.2 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>