More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0161 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0161  inner-membrane translocator  100 
 
 		 320 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2728  inner-membrane translocator  76.75 
 
 		 322 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0290  inner-membrane translocator  76.7 
 
 		 325 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3382  inner-membrane translocator  73.19 
 
 		 326 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1749  inner-membrane translocator  70.4 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.205001  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1581  inner-membrane translocator  57.05 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1588  inner-membrane translocator  58.12 
 
 		 343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.253198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4557  inner-membrane translocator  56.73 
 
 		 341 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5705  hypothetical protein  56.81 
 
 		 345 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.770663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2247  transmembrane ABC transporter protein  51.33 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0431032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2452  inner-membrane translocator  51.33 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2059  inner-membrane translocator  51.33 
 
 		 344 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4780  putative branched-chain amino acid ABC transport system permease  52.13 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00234016  normal  0.219755 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5148  inner-membrane translocator  50.49 
 
 		 320 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.432441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4008  inner-membrane translocator  52.63 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5446  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  45.71 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1363  inner-membrane translocator  47.19 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4297  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3477  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 333 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783038  normal  0.228237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4219  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3185  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2272  inner-membrane translocator  40.7 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0650  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0612  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.33 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.968851  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3732  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1179  inner-membrane translocator  40.24 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1079  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710188  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3531  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3535  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0298292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1050  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2583  inner-membrane translocator  39.11 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.48452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4079  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2304  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 329 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1482  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0617  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6328  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0657  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3458  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.494334  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0010  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3209  inner-membrane translocator  35.38 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3340  transmembrane ABC transporter protein  35.16 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3307  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5160  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 332 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.767449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1675  inner-membrane translocator  36 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2032  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 318 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2987  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.488268 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6269  inner-membrane translocator  36.25 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2558  ABC transporter permease  35.5 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.30876 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 652 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1795  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121113  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0957  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3595  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5859  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3911  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6025  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1379  inner-membrane translocator  36.4 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0010  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.429526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1620  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2564  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.47 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3483  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0021  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.25 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0195  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0936  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.13 
 
 		 656 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2951  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 323 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0213557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4477  branched-chain amino acid inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 332 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364038  normal  0.0227687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2868  inner-membrane translocator  32.74 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4999  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0649125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1805  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.50221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4270  inner-membrane translocator  34 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3367  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6572  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236609  normal  0.0263346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3556  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0669576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0366  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000392686  unclonable  0.0000000558621 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4209  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 346 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0640071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2422  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1286  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0089  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1448  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00412694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1990  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 315 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.97086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0078  inner-membrane translocator  36.1 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0663  inner-membrane translocator  37.19 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.722061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6433  inner-membrane translocator  32.57 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0224691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4820  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  35.25 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1517  inner-membrane translocator  33.47 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6573  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176253  normal  0.0417549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2015  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.60727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2139  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  35.97 
 
 		 594 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5726  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 347 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6090  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 347 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2122  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.589332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2025  inner-membrane translocator  30.94 
 
 		 339 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1732  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3460  inner-membrane translocator  35.02 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>