More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1081 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1081  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  626  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02537  transcriptional regulator  61.67 
 
 		 378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003578  LysR-family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 315 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0405  LysR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 324 aa  363  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00196923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0265  LysR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 312 aa  348  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318169 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0266  LysR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 311 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0296308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2060  transcriptional regulator, LysR family  53.49 
 
 		 306 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.670506  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1983  transcriptional regulator, LysR family protein  53.82 
 
 		 306 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2064  LysR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 306 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3945  LysR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2409  LysR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2285  LysR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 306 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000341943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2402  LysR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 306 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.298095  unclonable  0.0000087148 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0253  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0324  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2991  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  28.76 
 
 		 321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2446  LysR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 327 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3957  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0253  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 318 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88055 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00357  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002079  LysR-family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3495  regulatory protein, LysR  30.55 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0296  transcriptional regulator, LysR family protein  30.42 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4139  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3949  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 319 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4556  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3751  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3824  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3449  regulatory protein, LysR  30.07 
 
 		 326 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0195  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0195  transcriptional regulator, LysR family  29.49 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4272  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0544  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  29.24 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000427319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0342  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 335 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0214  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000152565  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3500  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0910886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2677  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.297592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1917  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3805  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.829403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4123  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 313 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000527418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3734  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 311 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457361 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3940  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4244  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000170817  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0216  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000946054  normal  0.293728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3932  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00420556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1773  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4143  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00216178  hitchhiker  0.000662316 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1036  transcriptional regulator of LysR family protein  29.04 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00455  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 341 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2971  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0274  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001991  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2696  LysR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3796  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000551  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 333 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  24.92 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  25.42 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  24.59 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0272  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  24.92 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2067  hypothetical protein  29.33 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3148  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.774562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1318  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  24.83 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2077  hypothetical protein  28.62 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0997  transcriptional regulator, LysR family  25.38 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1164  LysR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0213908  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5282  LysR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  23.36 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5422  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906945  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5440  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4829  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2222  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.176511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  24.5 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3501  LysR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.356591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0790  LysR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 313 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1317  transcriptional regulator, LysR family  24.92 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4063  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 310 aa  95.9  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.444174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  24.24 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0100  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  0.148828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  24.5 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0978  LysR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46330  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116434 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5270  LysR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2839  LysR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.587833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>