More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4322 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014159  Tpau_4322  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 433 aa  843    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3479  beta-ketoacyl synthase  50.83 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454254  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3468  beta-ketoacyl synthase  50.83 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3531  beta-ketoacyl synthase  50.83 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0636  Beta-ketoacyl synthase  53.86 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2694  beta-ketoacyl synthase  51.52 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.285093  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12407  polyketide synthetase mbtC  49.76 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3847  beta-ketoacyl synthase  52.12 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0508268  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 		 7110 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.25 
 
 		 1126 aa  352  8e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  48.55 
 
 		 3493 aa  352  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  46.74 
 
 		 7279 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  45.69 
 
 		 4840 aa  350  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12961  polyketide synthase pks15  46.05 
 
 		 496 aa  345  7e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.914056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  46.64 
 
 		 4080 aa  345  8e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  48.36 
 
 		 3254 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  45.9 
 
 		 2277 aa  343  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  45.56 
 
 		 3670 aa  342  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  45.22 
 
 		 7210 aa  342  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  46.35 
 
 		 1593 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.51 
 
 		 3930 aa  339  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  46.84 
 
 		 2090 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  44.99 
 
 		 4151 aa  339  7e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 		 3092 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  47.16 
 
 		 1143 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.65 
 
 		 1101 aa  337  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  47.9 
 
 		 3158 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  46.56 
 
 		 1602 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 		 3874 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  47.39 
 
 		 6768 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  45.69 
 
 		 2081 aa  335  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  42.89 
 
 		 3449 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  45.97 
 
 		 2107 aa  333  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  44.84 
 
 		 2108 aa  333  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  45.15 
 
 		 2966 aa  333  5e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  45.67 
 
 		 2126 aa  332  5e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  45.31 
 
 		 3463 aa  333  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.86 
 
 		 5400 aa  332  8e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  43.84 
 
 		 2719 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  45.83 
 
 		 3148 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.9 
 
 		 1867 aa  330  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  44.21 
 
 		 1071 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  46.35 
 
 		 3355 aa  329  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  46.01 
 
 		 3508 aa  328  8e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  45.85 
 
 		 2024 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  44.39 
 
 		 4111 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  43.52 
 
 		 1955 aa  325  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  45.37 
 
 		 3711 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  44.6 
 
 		 4264 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  44.44 
 
 		 2066 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  43.81 
 
 		 5154 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  44.11 
 
 		 1573 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  46.98 
 
 		 4575 aa  323  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  46.12 
 
 		 2846 aa  322  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  45.11 
 
 		 2020 aa  322  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  45.31 
 
 		 3494 aa  322  9.000000000000001e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  43.97 
 
 		 3408 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  43.16 
 
 		 3033 aa  319  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  45.18 
 
 		 2113 aa  319  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  44.31 
 
 		 2847 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  41.98 
 
 		 1114 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.94 
 
 		 2078 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  43.22 
 
 		 4882 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 		 1816 aa  313  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  46.51 
 
 		 4607 aa  312  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  42.73 
 
 		 5255 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  43.56 
 
 		 2374 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3890  erythronolide synthase  44.55 
 
 		 765 aa  309  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000750553  normal  0.261243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  45.27 
 
 		 4930 aa  309  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.26 
 
 		 1305 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  43.94 
 
 		 2367 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 		 1837 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  42.69 
 
 		 1548 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  42.46 
 
 		 1789 aa  306  6e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  43.82 
 
 		 1601 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  42.69 
 
 		 1831 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  41.8 
 
 		 3281 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  44.99 
 
 		 2666 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  42.52 
 
 		 1820 aa  299  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  42.25 
 
 		 2376 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  42.19 
 
 		 1584 aa  296  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  43.09 
 
 		 1077 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 		 2551 aa  292  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  39.16 
 
 		 2232 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.94 
 
 		 1349 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.94 
 
 		 1349 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.53 
 
 		 1372 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  36.66 
 
 		 1587 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  43.05 
 
 		 1924 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  40.69 
 
 		 3679 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.19 
 
 		 4478 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.67 
 
 		 3693 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.67 
 
 		 3693 aa  275  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.44 
 
 		 3702 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  40.38 
 
 		 2108 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  41.86 
 
 		 1537 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  39.86 
 
 		 2085 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  39.86 
 
 		 2085 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  39.86 
 
 		 2085 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  41.24 
 
 		 3427 aa  272  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>