More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1420 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1420  AraC protein arabinose-binding/dimerization  100 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  55.24 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  49.8 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  49.8 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  49 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 261 aa  178  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  43.53 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 283 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  41.13 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  37.71 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  40.16 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 288 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  40.18 
 
 		 265 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  40.64 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  39.73 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1171  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  34.54 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  36.1 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 272 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 272 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 272 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 272 aa  135  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  33.2 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2766  transcriptional regulator, AraC family  38.84 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 297 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  31.47 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  34.01 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.61 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 450 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  34.55 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5292  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>