More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3000 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3000  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 477 aa  952    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3136  benzoate-CoA ligase family  32.6 
 
 		 528 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2983  benzoate-CoA ligase  32.68 
 
 		 528 aa  190  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197545  normal  0.494918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2633  benzoate-CoA ligase family  30.57 
 
 		 513 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.710066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4656  benzoate-CoA ligase family  29.92 
 
 		 517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  33.46 
 
 		 549 aa  181  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0669  benzoate-CoA ligase family  30.61 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0896  benzoate-coenzyme A ligase  31.4 
 
 		 531 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  30.31 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0736  benzoate-CoA ligase family  29.8 
 
 		 539 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0730  benzoate-CoA ligase family  30.59 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1759  benzoate-CoA ligase  30.16 
 
 		 527 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00396412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2828  benzoate-CoA ligase family  28.74 
 
 		 525 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1327  benzoate-CoA ligase  31.56 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.618655  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51430  coenzyme A ligase  32.26 
 
 		 517 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1025  benzoate-CoA ligase family  30.08 
 
 		 524 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3360  benzoate-CoA ligase family  30.26 
 
 		 505 aa  171  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4402  coenzyme A ligase  31.99 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2397  benzoate-CoA ligase family  30.67 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0728  benzoate-CoA ligase family  29.34 
 
 		 524 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  29.07 
 
 		 533 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0878  benzoate-CoA ligase family  29.42 
 
 		 518 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36254  normal  0.31927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1526  benzoate-CoA ligase family  30.28 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.936301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0076  benzoate-CoA ligase family  30 
 
 		 518 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1016  benzoate-CoA ligase family  29.94 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1524  benzoate-CoA ligase family  29.42 
 
 		 503 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1624  benzoate-CoA ligase  29.22 
 
 		 526 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1534  benzoate-CoA ligase family  28.82 
 
 		 524 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7498  putative AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 537 aa  163  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.740274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1419  benzoate-coenzyme A ligase  28.86 
 
 		 530 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1543  benzoate-CoA ligase family  30.5 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.495782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3655  benzoate-CoA ligase family  28.79 
 
 		 531 aa  160  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  29.78 
 
 		 515 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2825  benzoate-CoA ligase family  28.57 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2700  benzoate-CoA ligase family  27.8 
 
 		 530 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0172  benzoate-CoA ligase family  31.89 
 
 		 554 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0216  benzoate-CoA ligase family  28.6 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0829  benzoate-CoA ligase  29.61 
 
 		 521 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0973123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2143  benzoate-CoA ligase family  29.04 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6534  benzoate-CoA ligase family  30.3 
 
 		 550 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1765  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459624  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3763  benzoate-coenzyme A ligase  30.85 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0336097  normal  0.403317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1370  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 513 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.31361  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3087  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 526 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.789973  normal  0.153239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 		 511 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5458  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 513 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.351223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2198  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 		 553 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153376  normal  0.142852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4971  AMP-dependent synthetase and ligase  26.21 
 
 		 556 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 546 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5092  benzoate-CoA ligase family  25.58 
 
 		 541 aa  130  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  29.84 
 
 		 6768 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0875  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 546 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0953  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386047  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 530 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  25.79 
 
 		 652 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  25.79 
 
 		 652 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03901  hypothetical protein  25.79 
 
 		 652 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4625  acetyl-CoA synthetase  25.79 
 
 		 652 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3958  acetyl-CoA synthetase  25.79 
 
 		 652 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.524009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4314  acetyl-CoA synthetase  25.79 
 
 		 652 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2238  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 		 538 aa  123  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.576533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 		 5154 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5574  acetyl-CoA synthetase  25.61 
 
 		 652 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2279  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 543 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4535  acetyl-CoA synthetase  25.61 
 
 		 652 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4531  acetyl-CoA synthetase  25.61 
 
 		 652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4621  acetyl-CoA synthetase  25.61 
 
 		 652 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4619  acetyl-CoA synthetase  25.61 
 
 		 652 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.341691  normal  0.539786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4528  acetyl-CoA synthetase  25.61 
 
 		 652 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4670  acetyl-CoA synthetase  25.61 
 
 		 652 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 		 506 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  29.22 
 
 		 3629 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  26.26 
 
 		 545 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3244  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 		 506 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  26.38 
 
 		 3335 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  26.02 
 
 		 515 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2180  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 		 548 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0275  putative acid-coenzyme A ligase  27.39 
 
 		 546 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 		 530 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1530  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.8 
 
 		 514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6454  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  25.45 
 
 		 546 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  26.47 
 
 		 4930 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 510 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7161  AMP-dependent synthetase and ligase  26.56 
 
 		 546 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 662 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  26.81 
 
 		 519 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  26.29 
 
 		 4101 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 		 523 aa  114  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6948  benzoate-CoA ligase family  27.9 
 
 		 535 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.33 
 
 		 560 aa  113  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  23.46 
 
 		 652 aa  113  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>