120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1452 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1452  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  100 
 
 		 458 aa  940    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.691281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  30.97 
 
 		 393 aa  144  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  30.85 
 
 		 386 aa  136  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  29.01 
 
 		 496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 398 aa  123  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 		 426 aa  120  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 386 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  26.97 
 
 		 472 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  29.58 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  28.34 
 
 		 480 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  29.94 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  27 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  27 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  26.96 
 
 		 385 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  26.96 
 
 		 385 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  26.54 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.26 
 
 		 519 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  24.74 
 
 		 517 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  25.78 
 
 		 385 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0358  extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 		 386 aa  98.2  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00342329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  24.88 
 
 		 512 aa  97.8  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  24.88 
 
 		 497 aa  97.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  25.24 
 
 		 425 aa  94  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  24.15 
 
 		 377 aa  91.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 		 380 aa  91.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  26.06 
 
 		 342 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 385 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  23.39 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2765  extracellular ligand-binding receptor  25.32 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.094864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  32.94 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  23.38 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  32.94 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  24.32 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  25.44 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  31.33 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  25.81 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  23.32 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  25.18 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  25.18 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  31.55 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  23.3 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  24.48 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 392 aa  67  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  21.39 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  22.22 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1661  hypothetical protein  31.61 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0550  extracellular ligand-binding receptor  20.88 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  28.26 
 
 		 592 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  27.37 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  20.83 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  20.94 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  27.15 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0065  Extracellular ligand-binding receptor  20.62 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  22.92 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2845  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  23.76 
 
 		 390 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  25.45 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2334  Extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 388 aa  56.6  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  20.23 
 
 		 383 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  24.23 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  25.41 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 		 387 aa  55.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  24.26 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2993  Extracellular ligand-binding receptor  23.99 
 
 		 363 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 		 390 aa  53.5  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3340  Extracellular ligand-binding receptor  23.31 
 
 		 394 aa  53.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157564  normal  0.523018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  22.57 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  23.32 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 		 377 aa  50.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  22.51 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 		 396 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 		 396 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  21.93 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  26.62 
 
 		 390 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0364  putative substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.57 
 
 		 390 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  23.17 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  24.22 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  25.97 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4388  extracellular ligand-binding receptor  23.37 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  27.62 
 
 		 403 aa  48.5  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  20 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>